Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Capn8Q91VA3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Capn8Q91VA3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Capn8Q91VA3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Capn8Q91VA3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Capn8Q91VA3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Capn8Q91VA3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Capn8Q91VA3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Capn8Q91VA3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Capn8Q91VA3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Capn8Q91VA3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Capn8Q91VA3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Capn8Q91VA3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Capn8Q91VA3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Capn8Q91VA3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Capn8Q91VA3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Capn8Q91VA3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Capn8Q91VA3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Capn8Q91VA3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Capn8Q91VA3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Capn8Q91VA3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Capn8Q91VA3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Capn8Q91VA3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Capn8Q91VA3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Capn8Q91VA3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Capn8Q91VA3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Capn8Q91VA3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Capn8Q91VA3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Capn8Q91VA3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Capn8Q91VA3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Capn8Q91VA3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Capn8Q91VA3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Capn8Q91VA3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Capn8Q91VA3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Capn8Q91VA3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Capn8Q91VA3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Capn8Q91VA3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Capn8Q91VA3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Capn8Q91VA3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Capn8Q91VA3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Capn8Q91VA3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Capn8Q91VA3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Capn8Q91VA3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Capn8Q91VA3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Capn8Q91VA3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Capn8Q91VA3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Capn8Q91VA3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Capn8Q91VA3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Capn8Q91VA3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Capn8Q91VA3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Capn8Q91VA3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Capn8Q91VA3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Capn8Q91VA3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Capn8Q91VA3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Capn8Q91VA3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Capn8Q91VA3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Capn8Q91VA3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Capn8Q91VA3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Capn8Q91VA3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Capn8Q91VA3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Capn8Q91VA3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Capn8Q91VA3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Capn8Q91VA3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Capn8Q91VA3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Capn8Q91VA3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Capn8Q91VA3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Capn8Q91VA3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Capn8Q91VA3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Capn8Q91VA3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Capn8Q91VA3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Capn8Q91VA3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Capn8Q91VA3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Capn8Q91VA3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Capn8Q91VA3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Capn8Q91VA3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Capn8Q91VA3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Capn8Q91VA3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Capn8Q91VA3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Capn8Q91VA3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Capn8Q91VA3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn8Q91VA3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Capn8Q91VA3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Capn8Q91VA3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Capn8Q91VA3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Capn8Q91VA3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn8Q91VA3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn8Q91VA3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn8Q91VA3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn8Q91VA3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn8Q91VA3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Capn8Q91VA3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Capn8Q91VA3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Capn8Q91VA3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Capn8Q91VA3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Capn8Q91VA3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Capn8Q91VA3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn8Q91VA3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Capn8Q91VA3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Capn8Q91VA3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Capn8Q91VA3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms