Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI88

Odf4, Outer dense fiber protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf4Q8VI88 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Odf4Q8VI88 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Odf4Q8VI88 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Odf4Q8VI88 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Odf4Q8VI88 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Odf4Q8VI88 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Odf4Q8VI88 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Odf4Q8VI88 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Odf4Q8VI88 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Odf4Q8VI88 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Odf4Q8VI88 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Odf4Q8VI88 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Odf4Q8VI88 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Odf4Q8VI88 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Odf4Q8VI88 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Odf4Q8VI88 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Odf4Q8VI88 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Odf4Q8VI88 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Odf4Q8VI88 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Odf4Q8VI88 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Odf4Q8VI88 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Odf4Q8VI88 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Odf4Q8VI88 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Odf4Q8VI88 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Odf4Q8VI88 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Odf4Q8VI88 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Odf4Q8VI88 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Odf4Q8VI88 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Odf4Q8VI88 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Odf4Q8VI88 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Odf4Q8VI88 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Odf4Q8VI88 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Odf4Q8VI88 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Odf4Q8VI88 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Odf4Q8VI88 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Odf4Q8VI88 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Odf4Q8VI88 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Odf4Q8VI88 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Odf4Q8VI88 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Odf4Q8VI88 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Odf4Q8VI88 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Odf4Q8VI88 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Odf4Q8VI88 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Odf4Q8VI88 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Odf4Q8VI88 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Odf4Q8VI88 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Odf4Q8VI88 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Odf4Q8VI88 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Odf4Q8VI88 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Odf4Q8VI88 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Odf4Q8VI88 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Odf4Q8VI88 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Odf4Q8VI88 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Odf4Q8VI88 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Odf4Q8VI88 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Odf4Q8VI88 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Odf4Q8VI88 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Odf4Q8VI88 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Odf4Q8VI88 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Odf4Q8VI88 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Odf4Q8VI88 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Odf4Q8VI88 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Odf4Q8VI88 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Odf4Q8VI88 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Odf4Q8VI88 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Odf4Q8VI88 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Odf4Q8VI88 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Odf4Q8VI88 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Odf4Q8VI88 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Odf4Q8VI88 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Odf4Q8VI88 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Odf4Q8VI88 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Odf4Q8VI88 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Odf4Q8VI88 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Odf4Q8VI88 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Odf4Q8VI88 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Odf4Q8VI88 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Odf4Q8VI88 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Odf4Q8VI88 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Odf4Q8VI88 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Odf4Q8VI88 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Odf4Q8VI88 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Odf4Q8VI88 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Odf4Q8VI88 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Odf4Q8VI88 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odf4Q8VI88 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Odf4Q8VI88 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Odf4Q8VI88 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Odf4Q8VI88 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Odf4Q8VI88 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Odf4Q8VI88 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Odf4Q8VI88 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Odf4Q8VI88 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Odf4Q8VI88 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Odf4Q8VI88 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Odf4Q8VI88 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Odf4Q8VI88 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Odf4Q8VI88 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Odf4Q8VI88 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Odf4Q8VI88 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms