Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Apol9aQ8VDU3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Apol9aQ8VDU3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Apol9aQ8VDU3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Apol9aQ8VDU3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Apol9aQ8VDU3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Apol9aQ8VDU3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Apol9aQ8VDU3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Apol9aQ8VDU3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Apol9aQ8VDU3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Apol9aQ8VDU3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Apol9aQ8VDU3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Apol9aQ8VDU3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Apol9aQ8VDU3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Apol9aQ8VDU3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Apol9aQ8VDU3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Apol9aQ8VDU3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Apol9aQ8VDU3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Apol9aQ8VDU3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Apol9aQ8VDU3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Apol9aQ8VDU3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Apol9aQ8VDU3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Apol9aQ8VDU3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Apol9aQ8VDU3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Apol9aQ8VDU3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Apol9aQ8VDU3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Apol9aQ8VDU3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Apol9aQ8VDU3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Apol9aQ8VDU3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Apol9aQ8VDU3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Apol9aQ8VDU3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Apol9aQ8VDU3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Apol9aQ8VDU3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Apol9aQ8VDU3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apol9aQ8VDU3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apol9aQ8VDU3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apol9aQ8VDU3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apol9aQ8VDU3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apol9aQ8VDU3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apol9aQ8VDU3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Apol9aQ8VDU3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Apol9aQ8VDU3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Apol9aQ8VDU3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Apol9aQ8VDU3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Apol9aQ8VDU3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Apol9aQ8VDU3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Apol9aQ8VDU3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Apol9aQ8VDU3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Apol9aQ8VDU3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Apol9aQ8VDU3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apol9aQ8VDU3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Apol9aQ8VDU3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Apol9aQ8VDU3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Apol9aQ8VDU3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apol9aQ8VDU3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apol9aQ8VDU3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apol9aQ8VDU3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Apol9aQ8VDU3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Apol9aQ8VDU3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Apol9aQ8VDU3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Apol9aQ8VDU3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Apol9aQ8VDU3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Apol9aQ8VDU3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Apol9aQ8VDU3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Apol9aQ8VDU3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Apol9aQ8VDU3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Apol9aQ8VDU3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apol9aQ8VDU3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apol9aQ8VDU3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apol9aQ8VDU3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apol9aQ8VDU3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apol9aQ8VDU3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apol9aQ8VDU3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apol9aQ8VDU3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apol9aQ8VDU3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apol9aQ8VDU3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Apol9aQ8VDU3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Apol9aQ8VDU3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Apol9aQ8VDU3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Apol9aQ8VDU3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Apol9aQ8VDU3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Apol9aQ8VDU3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Apol9aQ8VDU3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Apol9aQ8VDU3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Apol9aQ8VDU3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Apol9aQ8VDU3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Apol9aQ8VDU3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Apol9aQ8VDU3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Apol9aQ8VDU3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Apol9aQ8VDU3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Apol9aQ8VDU3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Apol9aQ8VDU3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Apol9aQ8VDU3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Apol9aQ8VDU3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Apol9aQ8VDU3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Apol9aQ8VDU3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apol9aQ8VDU3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apol9aQ8VDU3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apol9aQ8VDU3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Apol9aQ8VDU3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.5 ms