Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Uhrf1Q8VDF2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Uhrf1Q8VDF2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Uhrf1Q8VDF2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Uhrf1Q8VDF2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Uhrf1Q8VDF2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Uhrf1Q8VDF2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Uhrf1Q8VDF2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Uhrf1Q8VDF2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Uhrf1Q8VDF2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Uhrf1Q8VDF2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Uhrf1Q8VDF2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Uhrf1Q8VDF2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Uhrf1Q8VDF2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Uhrf1Q8VDF2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Uhrf1Q8VDF2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Uhrf1Q8VDF2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Uhrf1Q8VDF2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Uhrf1Q8VDF2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Uhrf1Q8VDF2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Uhrf1Q8VDF2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Uhrf1Q8VDF2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Uhrf1Q8VDF2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Uhrf1Q8VDF2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Uhrf1Q8VDF2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Uhrf1Q8VDF2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Uhrf1Q8VDF2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Uhrf1Q8VDF2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Uhrf1Q8VDF2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Uhrf1Q8VDF2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Uhrf1Q8VDF2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Uhrf1Q8VDF2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Uhrf1Q8VDF2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Uhrf1Q8VDF2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Uhrf1Q8VDF2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Uhrf1Q8VDF2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Uhrf1Q8VDF2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Uhrf1Q8VDF2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Uhrf1Q8VDF2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Uhrf1Q8VDF2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Uhrf1Q8VDF2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Uhrf1Q8VDF2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Uhrf1Q8VDF2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Uhrf1Q8VDF2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Uhrf1Q8VDF2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Uhrf1Q8VDF2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Uhrf1Q8VDF2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Uhrf1Q8VDF2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Uhrf1Q8VDF2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Uhrf1Q8VDF2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Uhrf1Q8VDF2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Uhrf1Q8VDF2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Uhrf1Q8VDF2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Uhrf1Q8VDF2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Uhrf1Q8VDF2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Uhrf1Q8VDF2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Uhrf1Q8VDF2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Uhrf1Q8VDF2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Uhrf1Q8VDF2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Uhrf1Q8VDF2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Uhrf1Q8VDF2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Uhrf1Q8VDF2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Uhrf1Q8VDF2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Uhrf1Q8VDF2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Uhrf1Q8VDF2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Uhrf1Q8VDF2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Uhrf1Q8VDF2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Uhrf1Q8VDF2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Uhrf1Q8VDF2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Uhrf1Q8VDF2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Uhrf1Q8VDF2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Uhrf1Q8VDF2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Uhrf1Q8VDF2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Uhrf1Q8VDF2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Uhrf1Q8VDF2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Uhrf1Q8VDF2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Uhrf1Q8VDF2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Uhrf1Q8VDF2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Uhrf1Q8VDF2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Uhrf1Q8VDF2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Uhrf1Q8VDF2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Uhrf1Q8VDF2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Uhrf1Q8VDF2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uhrf1Q8VDF2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uhrf1Q8VDF2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Uhrf1Q8VDF2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Uhrf1Q8VDF2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Uhrf1Q8VDF2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Uhrf1Q8VDF2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Uhrf1Q8VDF2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Uhrf1Q8VDF2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Uhrf1Q8VDF2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Uhrf1Q8VDF2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Uhrf1Q8VDF2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Uhrf1Q8VDF2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Uhrf1Q8VDF2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Uhrf1Q8VDF2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Uhrf1Q8VDF2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Uhrf1Q8VDF2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Uhrf1Q8VDF2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
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