Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDD8

Washc1, WASH complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc1Q8VDD8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Washc1Q8VDD8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Washc1Q8VDD8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Washc1Q8VDD8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Washc1Q8VDD8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Washc1Q8VDD8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Washc1Q8VDD8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Washc1Q8VDD8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Washc1Q8VDD8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Washc1Q8VDD8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Washc1Q8VDD8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Washc1Q8VDD8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Washc1Q8VDD8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Washc1Q8VDD8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Washc1Q8VDD8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Washc1Q8VDD8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Washc1Q8VDD8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Washc1Q8VDD8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Washc1Q8VDD8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Washc1Q8VDD8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Washc1Q8VDD8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Washc1Q8VDD8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Washc1Q8VDD8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Washc1Q8VDD8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Washc1Q8VDD8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Washc1Q8VDD8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Washc1Q8VDD8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Washc1Q8VDD8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Washc1Q8VDD8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Washc1Q8VDD8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Washc1Q8VDD8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Washc1Q8VDD8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Washc1Q8VDD8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Washc1Q8VDD8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Washc1Q8VDD8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Washc1Q8VDD8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Washc1Q8VDD8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Washc1Q8VDD8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Washc1Q8VDD8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Washc1Q8VDD8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Washc1Q8VDD8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Washc1Q8VDD8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Washc1Q8VDD8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Washc1Q8VDD8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Washc1Q8VDD8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Washc1Q8VDD8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Washc1Q8VDD8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Washc1Q8VDD8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Washc1Q8VDD8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Washc1Q8VDD8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Washc1Q8VDD8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Washc1Q8VDD8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Washc1Q8VDD8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Washc1Q8VDD8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Washc1Q8VDD8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Washc1Q8VDD8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Washc1Q8VDD8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Washc1Q8VDD8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Washc1Q8VDD8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Washc1Q8VDD8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Washc1Q8VDD8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Washc1Q8VDD8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Washc1Q8VDD8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Washc1Q8VDD8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Washc1Q8VDD8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Washc1Q8VDD8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Washc1Q8VDD8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Washc1Q8VDD8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Washc1Q8VDD8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Washc1Q8VDD8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Washc1Q8VDD8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Washc1Q8VDD8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Washc1Q8VDD8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Washc1Q8VDD8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Washc1Q8VDD8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Washc1Q8VDD8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Washc1Q8VDD8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Washc1Q8VDD8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Washc1Q8VDD8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Washc1Q8VDD8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Washc1Q8VDD8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Washc1Q8VDD8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Washc1Q8VDD8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Washc1Q8VDD8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Washc1Q8VDD8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Washc1Q8VDD8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Washc1Q8VDD8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Washc1Q8VDD8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Washc1Q8VDD8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Washc1Q8VDD8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Washc1Q8VDD8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Washc1Q8VDD8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Washc1Q8VDD8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Washc1Q8VDD8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Washc1Q8VDD8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Washc1Q8VDD8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Washc1Q8VDD8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Washc1Q8VDD8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Washc1Q8VDD8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Washc1Q8VDD8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms