Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc6a20aQ8VDB9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc6a20aQ8VDB9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc6a20aQ8VDB9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc6a20aQ8VDB9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc6a20aQ8VDB9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc6a20aQ8VDB9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc6a20aQ8VDB9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc6a20aQ8VDB9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc6a20aQ8VDB9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc6a20aQ8VDB9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc6a20aQ8VDB9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc6a20aQ8VDB9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc6a20aQ8VDB9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc6a20aQ8VDB9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc6a20aQ8VDB9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Slc6a20aQ8VDB9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc6a20aQ8VDB9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc6a20aQ8VDB9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc6a20aQ8VDB9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc6a20aQ8VDB9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc6a20aQ8VDB9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc6a20aQ8VDB9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc6a20aQ8VDB9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc6a20aQ8VDB9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Slc6a20aQ8VDB9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc6a20aQ8VDB9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc6a20aQ8VDB9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc6a20aQ8VDB9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc6a20aQ8VDB9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc6a20aQ8VDB9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc6a20aQ8VDB9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc6a20aQ8VDB9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc6a20aQ8VDB9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc6a20aQ8VDB9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc6a20aQ8VDB9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc6a20aQ8VDB9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc6a20aQ8VDB9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc6a20aQ8VDB9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc6a20aQ8VDB9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc6a20aQ8VDB9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc6a20aQ8VDB9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slc6a20aQ8VDB9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc6a20aQ8VDB9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc6a20aQ8VDB9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc6a20aQ8VDB9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc6a20aQ8VDB9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc6a20aQ8VDB9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc6a20aQ8VDB9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc6a20aQ8VDB9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc6a20aQ8VDB9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc6a20aQ8VDB9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc6a20aQ8VDB9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc6a20aQ8VDB9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc6a20aQ8VDB9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Slc6a20aQ8VDB9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc6a20aQ8VDB9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc6a20aQ8VDB9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc6a20aQ8VDB9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc6a20aQ8VDB9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc6a20aQ8VDB9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc6a20aQ8VDB9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc6a20aQ8VDB9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc6a20aQ8VDB9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc6a20aQ8VDB9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc6a20aQ8VDB9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc6a20aQ8VDB9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc6a20aQ8VDB9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc6a20aQ8VDB9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc6a20aQ8VDB9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc6a20aQ8VDB9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc6a20aQ8VDB9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc6a20aQ8VDB9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc6a20aQ8VDB9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc6a20aQ8VDB9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc6a20aQ8VDB9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc6a20aQ8VDB9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc6a20aQ8VDB9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc6a20aQ8VDB9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Slc6a20aQ8VDB9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Slc6a20aQ8VDB9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc6a20aQ8VDB9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc6a20aQ8VDB9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc6a20aQ8VDB9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc6a20aQ8VDB9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc6a20aQ8VDB9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc6a20aQ8VDB9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc6a20aQ8VDB9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc6a20aQ8VDB9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc6a20aQ8VDB9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc6a20aQ8VDB9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc6a20aQ8VDB9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc6a20aQ8VDB9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc6a20aQ8VDB9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc6a20aQ8VDB9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc6a20aQ8VDB9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc6a20aQ8VDB9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
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