Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC34

Rpap2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase Rpap2, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap2Q8VC34 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rpap2Q8VC34 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rpap2Q8VC34 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rpap2Q8VC34 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rpap2Q8VC34 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rpap2Q8VC34 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rpap2Q8VC34 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rpap2Q8VC34 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rpap2Q8VC34 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rpap2Q8VC34 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rpap2Q8VC34 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rpap2Q8VC34 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rpap2Q8VC34 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rpap2Q8VC34 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rpap2Q8VC34 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rpap2Q8VC34 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rpap2Q8VC34 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Rpap2Q8VC34 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rpap2Q8VC34 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rpap2Q8VC34 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rpap2Q8VC34 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rpap2Q8VC34 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rpap2Q8VC34 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rpap2Q8VC34 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rpap2Q8VC34 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rpap2Q8VC34 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rpap2Q8VC34 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rpap2Q8VC34 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Rpap2Q8VC34 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rpap2Q8VC34 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rpap2Q8VC34 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rpap2Q8VC34 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rpap2Q8VC34 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rpap2Q8VC34 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rpap2Q8VC34 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Rpap2Q8VC34 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rpap2Q8VC34 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rpap2Q8VC34 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rpap2Q8VC34 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rpap2Q8VC34 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rpap2Q8VC34 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rpap2Q8VC34 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rpap2Q8VC34 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rpap2Q8VC34 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Rpap2Q8VC34 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rpap2Q8VC34 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rpap2Q8VC34 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rpap2Q8VC34 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rpap2Q8VC34 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rpap2Q8VC34 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rpap2Q8VC34 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rpap2Q8VC34 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rpap2Q8VC34 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Rpap2Q8VC34 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rpap2Q8VC34 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rpap2Q8VC34 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rpap2Q8VC34 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rpap2Q8VC34 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rpap2Q8VC34 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rpap2Q8VC34 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rpap2Q8VC34 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rpap2Q8VC34 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rpap2Q8VC34 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rpap2Q8VC34 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rpap2Q8VC34 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rpap2Q8VC34 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rpap2Q8VC34 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rpap2Q8VC34 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rpap2Q8VC34 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rpap2Q8VC34 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rpap2Q8VC34 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rpap2Q8VC34 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rpap2Q8VC34 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rpap2Q8VC34 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rpap2Q8VC34 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rpap2Q8VC34 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rpap2Q8VC34 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rpap2Q8VC34 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rpap2Q8VC34 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rpap2Q8VC34 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rpap2Q8VC34 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rpap2Q8VC34 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rpap2Q8VC34 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Rpap2Q8VC34 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rpap2Q8VC34 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rpap2Q8VC34 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rpap2Q8VC34 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rpap2Q8VC34 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rpap2Q8VC34 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Rpap2Q8VC34 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rpap2Q8VC34 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rpap2Q8VC34 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rpap2Q8VC34 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rpap2Q8VC34 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rpap2Q8VC34 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rpap2Q8VC34 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rpap2Q8VC34 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rpap2Q8VC34 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rpap2Q8VC34 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rpap2Q8VC34 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms