Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D5

Trpm8, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm8Q8R4D5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm8Q8R4D5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm8Q8R4D5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm8Q8R4D5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpm8Q8R4D5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trpm8Q8R4D5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpm8Q8R4D5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpm8Q8R4D5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpm8Q8R4D5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpm8Q8R4D5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpm8Q8R4D5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpm8Q8R4D5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpm8Q8R4D5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpm8Q8R4D5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpm8Q8R4D5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpm8Q8R4D5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpm8Q8R4D5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpm8Q8R4D5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpm8Q8R4D5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trpm8Q8R4D5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpm8Q8R4D5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpm8Q8R4D5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpm8Q8R4D5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpm8Q8R4D5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpm8Q8R4D5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpm8Q8R4D5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpm8Q8R4D5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpm8Q8R4D5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpm8Q8R4D5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpm8Q8R4D5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpm8Q8R4D5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm8Q8R4D5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm8Q8R4D5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpm8Q8R4D5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpm8Q8R4D5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpm8Q8R4D5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpm8Q8R4D5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpm8Q8R4D5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpm8Q8R4D5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpm8Q8R4D5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpm8Q8R4D5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpm8Q8R4D5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpm8Q8R4D5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpm8Q8R4D5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpm8Q8R4D5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpm8Q8R4D5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpm8Q8R4D5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpm8Q8R4D5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpm8Q8R4D5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpm8Q8R4D5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpm8Q8R4D5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpm8Q8R4D5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpm8Q8R4D5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpm8Q8R4D5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpm8Q8R4D5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpm8Q8R4D5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trpm8Q8R4D5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpm8Q8R4D5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpm8Q8R4D5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpm8Q8R4D5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm8Q8R4D5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm8Q8R4D5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm8Q8R4D5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm8Q8R4D5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm8Q8R4D5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm8Q8R4D5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpm8Q8R4D5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpm8Q8R4D5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpm8Q8R4D5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpm8Q8R4D5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm8Q8R4D5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm8Q8R4D5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpm8Q8R4D5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpm8Q8R4D5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpm8Q8R4D5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpm8Q8R4D5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpm8Q8R4D5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trpm8Q8R4D5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpm8Q8R4D5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpm8Q8R4D5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpm8Q8R4D5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpm8Q8R4D5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpm8Q8R4D5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpm8Q8R4D5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpm8Q8R4D5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpm8Q8R4D5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpm8Q8R4D5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpm8Q8R4D5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpm8Q8R4D5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpm8Q8R4D5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpm8Q8R4D5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpm8Q8R4D5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpm8Q8R4D5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpm8Q8R4D5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpm8Q8R4D5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trpm8Q8R4D5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpm8Q8R4D5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpm8Q8R4D5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpm8Q8R4D5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpm8Q8R4D5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms