Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3B1

Plcd1, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase delta-1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcd1Q8R3B1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Plcd1Q8R3B1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Plcd1Q8R3B1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Plcd1Q8R3B1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Plcd1Q8R3B1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Plcd1Q8R3B1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Plcd1Q8R3B1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Plcd1Q8R3B1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Plcd1Q8R3B1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Plcd1Q8R3B1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Plcd1Q8R3B1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Plcd1Q8R3B1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Plcd1Q8R3B1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Plcd1Q8R3B1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Plcd1Q8R3B1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Plcd1Q8R3B1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Plcd1Q8R3B1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Plcd1Q8R3B1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Plcd1Q8R3B1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Plcd1Q8R3B1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Plcd1Q8R3B1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Plcd1Q8R3B1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Plcd1Q8R3B1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Plcd1Q8R3B1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Plcd1Q8R3B1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Plcd1Q8R3B1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Plcd1Q8R3B1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Plcd1Q8R3B1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Plcd1Q8R3B1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Plcd1Q8R3B1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Plcd1Q8R3B1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Plcd1Q8R3B1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Plcd1Q8R3B1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Plcd1Q8R3B1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Plcd1Q8R3B1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Plcd1Q8R3B1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Plcd1Q8R3B1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Plcd1Q8R3B1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Plcd1Q8R3B1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Plcd1Q8R3B1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Plcd1Q8R3B1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Plcd1Q8R3B1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Plcd1Q8R3B1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Plcd1Q8R3B1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Plcd1Q8R3B1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Plcd1Q8R3B1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Plcd1Q8R3B1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Plcd1Q8R3B1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Plcd1Q8R3B1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Plcd1Q8R3B1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Plcd1Q8R3B1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Plcd1Q8R3B1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Plcd1Q8R3B1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Plcd1Q8R3B1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Plcd1Q8R3B1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Plcd1Q8R3B1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Plcd1Q8R3B1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Plcd1Q8R3B1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Plcd1Q8R3B1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Plcd1Q8R3B1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Plcd1Q8R3B1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Plcd1Q8R3B1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Plcd1Q8R3B1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Plcd1Q8R3B1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Plcd1Q8R3B1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Plcd1Q8R3B1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Plcd1Q8R3B1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Plcd1Q8R3B1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Plcd1Q8R3B1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Plcd1Q8R3B1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Plcd1Q8R3B1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Plcd1Q8R3B1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Plcd1Q8R3B1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Plcd1Q8R3B1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Plcd1Q8R3B1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Plcd1Q8R3B1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Plcd1Q8R3B1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Plcd1Q8R3B1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Plcd1Q8R3B1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Plcd1Q8R3B1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Plcd1Q8R3B1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Plcd1Q8R3B1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Plcd1Q8R3B1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Plcd1Q8R3B1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Plcd1Q8R3B1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Plcd1Q8R3B1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Plcd1Q8R3B1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Plcd1Q8R3B1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Plcd1Q8R3B1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Plcd1Q8R3B1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Plcd1Q8R3B1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Plcd1Q8R3B1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Plcd1Q8R3B1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Plcd1Q8R3B1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Plcd1Q8R3B1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Plcd1Q8R3B1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Plcd1Q8R3B1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Plcd1Q8R3B1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Plcd1Q8R3B1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Plcd1Q8R3B1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms