Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rdh16f2Q8K3M1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rdh16f2Q8K3M1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rdh16f2Q8K3M1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rdh16f2Q8K3M1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rdh16f2Q8K3M1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rdh16f2Q8K3M1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rdh16f2Q8K3M1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rdh16f2Q8K3M1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rdh16f2Q8K3M1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rdh16f2Q8K3M1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rdh16f2Q8K3M1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rdh16f2Q8K3M1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rdh16f2Q8K3M1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rdh16f2Q8K3M1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rdh16f2Q8K3M1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rdh16f2Q8K3M1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rdh16f2Q8K3M1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rdh16f2Q8K3M1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rdh16f2Q8K3M1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rdh16f2Q8K3M1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rdh16f2Q8K3M1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rdh16f2Q8K3M1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rdh16f2Q8K3M1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rdh16f2Q8K3M1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rdh16f2Q8K3M1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rdh16f2Q8K3M1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rdh16f2Q8K3M1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rdh16f2Q8K3M1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rdh16f2Q8K3M1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rdh16f2Q8K3M1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rdh16f2Q8K3M1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rdh16f2Q8K3M1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rdh16f2Q8K3M1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rdh16f2Q8K3M1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rdh16f2Q8K3M1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rdh16f2Q8K3M1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rdh16f2Q8K3M1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rdh16f2Q8K3M1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rdh16f2Q8K3M1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rdh16f2Q8K3M1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rdh16f2Q8K3M1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rdh16f2Q8K3M1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rdh16f2Q8K3M1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rdh16f2Q8K3M1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rdh16f2Q8K3M1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rdh16f2Q8K3M1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rdh16f2Q8K3M1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rdh16f2Q8K3M1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rdh16f2Q8K3M1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rdh16f2Q8K3M1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rdh16f2Q8K3M1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rdh16f2Q8K3M1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rdh16f2Q8K3M1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rdh16f2Q8K3M1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rdh16f2Q8K3M1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rdh16f2Q8K3M1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rdh16f2Q8K3M1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rdh16f2Q8K3M1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rdh16f2Q8K3M1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rdh16f2Q8K3M1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rdh16f2Q8K3M1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rdh16f2Q8K3M1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rdh16f2Q8K3M1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rdh16f2Q8K3M1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rdh16f2Q8K3M1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rdh16f2Q8K3M1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rdh16f2Q8K3M1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rdh16f2Q8K3M1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rdh16f2Q8K3M1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rdh16f2Q8K3M1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Rdh16f2Q8K3M1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rdh16f2Q8K3M1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rdh16f2Q8K3M1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rdh16f2Q8K3M1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rdh16f2Q8K3M1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rdh16f2Q8K3M1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rdh16f2Q8K3M1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rdh16f2Q8K3M1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rdh16f2Q8K3M1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rdh16f2Q8K3M1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rdh16f2Q8K3M1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rdh16f2Q8K3M1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rdh16f2Q8K3M1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rdh16f2Q8K3M1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rdh16f2Q8K3M1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rdh16f2Q8K3M1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rdh16f2Q8K3M1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rdh16f2Q8K3M1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rdh16f2Q8K3M1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rdh16f2Q8K3M1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rdh16f2Q8K3M1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rdh16f2Q8K3M1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rdh16f2Q8K3M1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rdh16f2Q8K3M1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rdh16f2Q8K3M1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rdh16f2Q8K3M1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rdh16f2Q8K3M1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rdh16f2Q8K3M1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms