Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Depp1Q8K2F3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Depp1Q8K2F3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Depp1Q8K2F3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Depp1Q8K2F3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Depp1Q8K2F3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Depp1Q8K2F3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Depp1Q8K2F3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Depp1Q8K2F3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Depp1Q8K2F3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Depp1Q8K2F3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Depp1Q8K2F3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Depp1Q8K2F3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Depp1Q8K2F3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Depp1Q8K2F3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Depp1Q8K2F3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Depp1Q8K2F3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Depp1Q8K2F3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Depp1Q8K2F3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Depp1Q8K2F3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Depp1Q8K2F3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Depp1Q8K2F3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Depp1Q8K2F3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Depp1Q8K2F3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Depp1Q8K2F3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Depp1Q8K2F3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Depp1Q8K2F3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Depp1Q8K2F3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Depp1Q8K2F3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Depp1Q8K2F3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Depp1Q8K2F3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Depp1Q8K2F3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Depp1Q8K2F3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Depp1Q8K2F3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Depp1Q8K2F3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Depp1Q8K2F3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Depp1Q8K2F3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Depp1Q8K2F3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Depp1Q8K2F3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Depp1Q8K2F3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Depp1Q8K2F3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Depp1Q8K2F3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Depp1Q8K2F3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Depp1Q8K2F3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Depp1Q8K2F3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Depp1Q8K2F3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Depp1Q8K2F3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Depp1Q8K2F3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Depp1Q8K2F3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Depp1Q8K2F3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Depp1Q8K2F3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Depp1Q8K2F3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Depp1Q8K2F3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Depp1Q8K2F3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Depp1Q8K2F3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Depp1Q8K2F3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Depp1Q8K2F3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Depp1Q8K2F3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Depp1Q8K2F3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Depp1Q8K2F3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Depp1Q8K2F3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Depp1Q8K2F3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Depp1Q8K2F3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Depp1Q8K2F3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Depp1Q8K2F3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Depp1Q8K2F3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Depp1Q8K2F3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Depp1Q8K2F3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Depp1Q8K2F3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Depp1Q8K2F3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Depp1Q8K2F3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Depp1Q8K2F3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Depp1Q8K2F3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Depp1Q8K2F3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Depp1Q8K2F3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Depp1Q8K2F3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Depp1Q8K2F3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Depp1Q8K2F3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Depp1Q8K2F3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Depp1Q8K2F3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Depp1Q8K2F3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Depp1Q8K2F3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Depp1Q8K2F3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Depp1Q8K2F3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Depp1Q8K2F3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Depp1Q8K2F3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Depp1Q8K2F3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Depp1Q8K2F3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Depp1Q8K2F3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Depp1Q8K2F3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Depp1Q8K2F3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Depp1Q8K2F3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Depp1Q8K2F3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Depp1Q8K2F3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Depp1Q8K2F3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Depp1Q8K2F3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Depp1Q8K2F3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Depp1Q8K2F3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Depp1Q8K2F3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Depp1Q8K2F3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.9 ms