Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scara5Q8K299 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scara5Q8K299 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scara5Q8K299 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scara5Q8K299 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scara5Q8K299 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scara5Q8K299 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scara5Q8K299 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scara5Q8K299 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scara5Q8K299 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scara5Q8K299 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scara5Q8K299 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scara5Q8K299 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scara5Q8K299 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scara5Q8K299 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Scara5Q8K299 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scara5Q8K299 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scara5Q8K299 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scara5Q8K299 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scara5Q8K299 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scara5Q8K299 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scara5Q8K299 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scara5Q8K299 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Scara5Q8K299 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scara5Q8K299 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scara5Q8K299 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Scara5Q8K299 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scara5Q8K299 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scara5Q8K299 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scara5Q8K299 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scara5Q8K299 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scara5Q8K299 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scara5Q8K299 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scara5Q8K299 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scara5Q8K299 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scara5Q8K299 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scara5Q8K299 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scara5Q8K299 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scara5Q8K299 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scara5Q8K299 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scara5Q8K299 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scara5Q8K299 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Scara5Q8K299 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scara5Q8K299 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Scara5Q8K299 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scara5Q8K299 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scara5Q8K299 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scara5Q8K299 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scara5Q8K299 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scara5Q8K299 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scara5Q8K299 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scara5Q8K299 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Scara5Q8K299 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scara5Q8K299 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Scara5Q8K299 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scara5Q8K299 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scara5Q8K299 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scara5Q8K299 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scara5Q8K299 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scara5Q8K299 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scara5Q8K299 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scara5Q8K299 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scara5Q8K299 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scara5Q8K299 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scara5Q8K299 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Scara5Q8K299 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scara5Q8K299 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scara5Q8K299 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scara5Q8K299 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scara5Q8K299 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scara5Q8K299 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scara5Q8K299 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scara5Q8K299 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scara5Q8K299 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scara5Q8K299 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scara5Q8K299 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scara5Q8K299 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scara5Q8K299 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scara5Q8K299 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scara5Q8K299 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scara5Q8K299 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scara5Q8K299 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scara5Q8K299 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scara5Q8K299 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scara5Q8K299 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scara5Q8K299 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scara5Q8K299 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Scara5Q8K299 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scara5Q8K299 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scara5Q8K299 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scara5Q8K299 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scara5Q8K299 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scara5Q8K299 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scara5Q8K299 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Scara5Q8K299 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scara5Q8K299 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scara5Q8K299 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Scara5Q8K299 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scara5Q8K299 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scara5Q8K299 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms