Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pacs1Q8K212 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pacs1Q8K212 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pacs1Q8K212 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pacs1Q8K212 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pacs1Q8K212 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pacs1Q8K212 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pacs1Q8K212 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pacs1Q8K212 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pacs1Q8K212 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pacs1Q8K212 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pacs1Q8K212 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pacs1Q8K212 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pacs1Q8K212 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pacs1Q8K212 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pacs1Q8K212 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pacs1Q8K212 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pacs1Q8K212 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pacs1Q8K212 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Pacs1Q8K212 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pacs1Q8K212 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pacs1Q8K212 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pacs1Q8K212 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pacs1Q8K212 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pacs1Q8K212 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pacs1Q8K212 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pacs1Q8K212 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pacs1Q8K212 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pacs1Q8K212 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pacs1Q8K212 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pacs1Q8K212 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pacs1Q8K212 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pacs1Q8K212 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pacs1Q8K212 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pacs1Q8K212 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pacs1Q8K212 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pacs1Q8K212 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pacs1Q8K212 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pacs1Q8K212 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pacs1Q8K212 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pacs1Q8K212 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pacs1Q8K212 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pacs1Q8K212 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pacs1Q8K212 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pacs1Q8K212 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Pacs1Q8K212 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pacs1Q8K212 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pacs1Q8K212 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pacs1Q8K212 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pacs1Q8K212 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pacs1Q8K212 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Pacs1Q8K212 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pacs1Q8K212 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pacs1Q8K212 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pacs1Q8K212 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pacs1Q8K212 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pacs1Q8K212 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pacs1Q8K212 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pacs1Q8K212 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Pacs1Q8K212 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Pacs1Q8K212 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pacs1Q8K212 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pacs1Q8K212 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pacs1Q8K212 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pacs1Q8K212 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pacs1Q8K212 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pacs1Q8K212 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pacs1Q8K212 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pacs1Q8K212 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pacs1Q8K212 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pacs1Q8K212 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pacs1Q8K212 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pacs1Q8K212 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pacs1Q8K212 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pacs1Q8K212 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pacs1Q8K212 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pacs1Q8K212 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pacs1Q8K212 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pacs1Q8K212 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pacs1Q8K212 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pacs1Q8K212 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pacs1Q8K212 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pacs1Q8K212 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Pacs1Q8K212 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pacs1Q8K212 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pacs1Q8K212 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pacs1Q8K212 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pacs1Q8K212 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pacs1Q8K212 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pacs1Q8K212 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pacs1Q8K212 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pacs1Q8K212 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pacs1Q8K212 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pacs1Q8K212 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pacs1Q8K212 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pacs1Q8K212 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pacs1Q8K212 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pacs1Q8K212 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pacs1Q8K212 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pacs1Q8K212 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms