Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0H1

Slc47a1, Multidrug and toxin extrusion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc47a1Q8K0H1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc47a1Q8K0H1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc47a1Q8K0H1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc47a1Q8K0H1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc47a1Q8K0H1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc47a1Q8K0H1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc47a1Q8K0H1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc47a1Q8K0H1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc47a1Q8K0H1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc47a1Q8K0H1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc47a1Q8K0H1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc47a1Q8K0H1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc47a1Q8K0H1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc47a1Q8K0H1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc47a1Q8K0H1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc47a1Q8K0H1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc47a1Q8K0H1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc47a1Q8K0H1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc47a1Q8K0H1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc47a1Q8K0H1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc47a1Q8K0H1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc47a1Q8K0H1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc47a1Q8K0H1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc47a1Q8K0H1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc47a1Q8K0H1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc47a1Q8K0H1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc47a1Q8K0H1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc47a1Q8K0H1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc47a1Q8K0H1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc47a1Q8K0H1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc47a1Q8K0H1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc47a1Q8K0H1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc47a1Q8K0H1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc47a1Q8K0H1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc47a1Q8K0H1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc47a1Q8K0H1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc47a1Q8K0H1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc47a1Q8K0H1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc47a1Q8K0H1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc47a1Q8K0H1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc47a1Q8K0H1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc47a1Q8K0H1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc47a1Q8K0H1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc47a1Q8K0H1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc47a1Q8K0H1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc47a1Q8K0H1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc47a1Q8K0H1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc47a1Q8K0H1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc47a1Q8K0H1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slc47a1Q8K0H1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc47a1Q8K0H1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc47a1Q8K0H1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc47a1Q8K0H1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc47a1Q8K0H1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc47a1Q8K0H1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc47a1Q8K0H1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc47a1Q8K0H1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc47a1Q8K0H1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc47a1Q8K0H1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc47a1Q8K0H1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc47a1Q8K0H1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc47a1Q8K0H1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc47a1Q8K0H1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc47a1Q8K0H1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc47a1Q8K0H1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc47a1Q8K0H1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc47a1Q8K0H1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc47a1Q8K0H1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc47a1Q8K0H1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc47a1Q8K0H1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc47a1Q8K0H1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc47a1Q8K0H1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc47a1Q8K0H1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc47a1Q8K0H1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc47a1Q8K0H1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc47a1Q8K0H1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc47a1Q8K0H1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc47a1Q8K0H1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc47a1Q8K0H1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc47a1Q8K0H1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc47a1Q8K0H1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc47a1Q8K0H1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc47a1Q8K0H1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc47a1Q8K0H1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc47a1Q8K0H1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc47a1Q8K0H1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc47a1Q8K0H1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc47a1Q8K0H1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc47a1Q8K0H1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc47a1Q8K0H1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc47a1Q8K0H1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc47a1Q8K0H1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc47a1Q8K0H1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc47a1Q8K0H1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc47a1Q8K0H1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc47a1Q8K0H1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc47a1Q8K0H1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc47a1Q8K0H1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc47a1Q8K0H1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc47a1Q8K0H1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms