Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LgsnQ8CIX8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LgsnQ8CIX8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LgsnQ8CIX8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LgsnQ8CIX8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LgsnQ8CIX8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LgsnQ8CIX8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LgsnQ8CIX8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LgsnQ8CIX8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LgsnQ8CIX8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LgsnQ8CIX8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LgsnQ8CIX8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LgsnQ8CIX8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LgsnQ8CIX8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LgsnQ8CIX8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LgsnQ8CIX8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LgsnQ8CIX8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LgsnQ8CIX8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LgsnQ8CIX8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LgsnQ8CIX8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LgsnQ8CIX8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LgsnQ8CIX8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LgsnQ8CIX8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LgsnQ8CIX8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LgsnQ8CIX8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LgsnQ8CIX8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LgsnQ8CIX8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LgsnQ8CIX8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LgsnQ8CIX8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LgsnQ8CIX8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LgsnQ8CIX8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LgsnQ8CIX8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LgsnQ8CIX8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LgsnQ8CIX8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LgsnQ8CIX8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LgsnQ8CIX8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LgsnQ8CIX8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LgsnQ8CIX8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LgsnQ8CIX8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LgsnQ8CIX8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LgsnQ8CIX8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LgsnQ8CIX8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LgsnQ8CIX8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LgsnQ8CIX8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LgsnQ8CIX8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LgsnQ8CIX8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LgsnQ8CIX8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LgsnQ8CIX8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LgsnQ8CIX8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LgsnQ8CIX8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LgsnQ8CIX8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LgsnQ8CIX8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LgsnQ8CIX8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LgsnQ8CIX8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LgsnQ8CIX8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LgsnQ8CIX8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
LgsnQ8CIX8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LgsnQ8CIX8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LgsnQ8CIX8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LgsnQ8CIX8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LgsnQ8CIX8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LgsnQ8CIX8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LgsnQ8CIX8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LgsnQ8CIX8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LgsnQ8CIX8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LgsnQ8CIX8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LgsnQ8CIX8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LgsnQ8CIX8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LgsnQ8CIX8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LgsnQ8CIX8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LgsnQ8CIX8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LgsnQ8CIX8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LgsnQ8CIX8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LgsnQ8CIX8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LgsnQ8CIX8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LgsnQ8CIX8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LgsnQ8CIX8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LgsnQ8CIX8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LgsnQ8CIX8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LgsnQ8CIX8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LgsnQ8CIX8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LgsnQ8CIX8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LgsnQ8CIX8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LgsnQ8CIX8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LgsnQ8CIX8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LgsnQ8CIX8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LgsnQ8CIX8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LgsnQ8CIX8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LgsnQ8CIX8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LgsnQ8CIX8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LgsnQ8CIX8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LgsnQ8CIX8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LgsnQ8CIX8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LgsnQ8CIX8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LgsnQ8CIX8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LgsnQ8CIX8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LgsnQ8CIX8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LgsnQ8CIX8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LgsnQ8CIX8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LgsnQ8CIX8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms