Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIG8

Prmt5, Protein arginine N-methyltransferase 5, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prmt5Q8CIG8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prmt5Q8CIG8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prmt5Q8CIG8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prmt5Q8CIG8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prmt5Q8CIG8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prmt5Q8CIG8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prmt5Q8CIG8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prmt5Q8CIG8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prmt5Q8CIG8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prmt5Q8CIG8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prmt5Q8CIG8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prmt5Q8CIG8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prmt5Q8CIG8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prmt5Q8CIG8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prmt5Q8CIG8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prmt5Q8CIG8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prmt5Q8CIG8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prmt5Q8CIG8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prmt5Q8CIG8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prmt5Q8CIG8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prmt5Q8CIG8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prmt5Q8CIG8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prmt5Q8CIG8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prmt5Q8CIG8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prmt5Q8CIG8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prmt5Q8CIG8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prmt5Q8CIG8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Prmt5Q8CIG8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prmt5Q8CIG8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prmt5Q8CIG8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Prmt5Q8CIG8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prmt5Q8CIG8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prmt5Q8CIG8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prmt5Q8CIG8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prmt5Q8CIG8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prmt5Q8CIG8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prmt5Q8CIG8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prmt5Q8CIG8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prmt5Q8CIG8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prmt5Q8CIG8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prmt5Q8CIG8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prmt5Q8CIG8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prmt5Q8CIG8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Prmt5Q8CIG8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prmt5Q8CIG8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prmt5Q8CIG8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prmt5Q8CIG8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prmt5Q8CIG8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Prmt5Q8CIG8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prmt5Q8CIG8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prmt5Q8CIG8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prmt5Q8CIG8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prmt5Q8CIG8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prmt5Q8CIG8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prmt5Q8CIG8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prmt5Q8CIG8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prmt5Q8CIG8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prmt5Q8CIG8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prmt5Q8CIG8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prmt5Q8CIG8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prmt5Q8CIG8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prmt5Q8CIG8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prmt5Q8CIG8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prmt5Q8CIG8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Prmt5Q8CIG8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prmt5Q8CIG8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prmt5Q8CIG8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Prmt5Q8CIG8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Prmt5Q8CIG8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prmt5Q8CIG8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prmt5Q8CIG8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prmt5Q8CIG8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prmt5Q8CIG8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prmt5Q8CIG8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Prmt5Q8CIG8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prmt5Q8CIG8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prmt5Q8CIG8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prmt5Q8CIG8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prmt5Q8CIG8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Prmt5Q8CIG8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Prmt5Q8CIG8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Prmt5Q8CIG8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Prmt5Q8CIG8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prmt5Q8CIG8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prmt5Q8CIG8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prmt5Q8CIG8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prmt5Q8CIG8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prmt5Q8CIG8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prmt5Q8CIG8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prmt5Q8CIG8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prmt5Q8CIG8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prmt5Q8CIG8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prmt5Q8CIG8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prmt5Q8CIG8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prmt5Q8CIG8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prmt5Q8CIG8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prmt5Q8CIG8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Prmt5Q8CIG8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prmt5Q8CIG8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prmt5Q8CIG8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms