Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHS2

Dnajc22, DnaJ homolog subfamily C member 22, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc22Q8CHS2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnajc22Q8CHS2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnajc22Q8CHS2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnajc22Q8CHS2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnajc22Q8CHS2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnajc22Q8CHS2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnajc22Q8CHS2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnajc22Q8CHS2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnajc22Q8CHS2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dnajc22Q8CHS2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dnajc22Q8CHS2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dnajc22Q8CHS2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnajc22Q8CHS2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnajc22Q8CHS2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnajc22Q8CHS2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnajc22Q8CHS2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnajc22Q8CHS2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnajc22Q8CHS2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnajc22Q8CHS2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnajc22Q8CHS2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnajc22Q8CHS2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnajc22Q8CHS2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnajc22Q8CHS2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnajc22Q8CHS2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnajc22Q8CHS2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnajc22Q8CHS2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnajc22Q8CHS2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnajc22Q8CHS2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnajc22Q8CHS2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Dnajc22Q8CHS2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnajc22Q8CHS2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnajc22Q8CHS2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnajc22Q8CHS2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnajc22Q8CHS2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnajc22Q8CHS2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnajc22Q8CHS2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnajc22Q8CHS2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnajc22Q8CHS2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnajc22Q8CHS2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnajc22Q8CHS2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnajc22Q8CHS2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnajc22Q8CHS2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnajc22Q8CHS2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnajc22Q8CHS2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnajc22Q8CHS2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnajc22Q8CHS2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnajc22Q8CHS2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnajc22Q8CHS2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnajc22Q8CHS2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnajc22Q8CHS2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnajc22Q8CHS2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnajc22Q8CHS2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnajc22Q8CHS2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnajc22Q8CHS2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnajc22Q8CHS2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnajc22Q8CHS2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnajc22Q8CHS2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnajc22Q8CHS2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnajc22Q8CHS2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnajc22Q8CHS2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnajc22Q8CHS2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnajc22Q8CHS2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnajc22Q8CHS2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnajc22Q8CHS2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnajc22Q8CHS2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnajc22Q8CHS2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnajc22Q8CHS2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnajc22Q8CHS2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajc22Q8CHS2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajc22Q8CHS2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajc22Q8CHS2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dnajc22Q8CHS2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnajc22Q8CHS2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnajc22Q8CHS2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnajc22Q8CHS2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajc22Q8CHS2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajc22Q8CHS2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnajc22Q8CHS2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajc22Q8CHS2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajc22Q8CHS2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajc22Q8CHS2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajc22Q8CHS2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajc22Q8CHS2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dnajc22Q8CHS2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.33■■□□□ 1
Dnajc22Q8CHS2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajc22Q8CHS2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajc22Q8CHS2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajc22Q8CHS2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajc22Q8CHS2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc22Q8CHS2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc22Q8CHS2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajc22Q8CHS2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc22Q8CHS2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc22Q8CHS2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc22Q8CHS2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc22Q8CHS2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Dnajc22Q8CHS2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajc22Q8CHS2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajc22Q8CHS2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajc22Q8CHS2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms