Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF6

Wdr47, WD repeat-containing protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 920 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr47Q8CGF6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Wdr47Q8CGF6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Wdr47Q8CGF6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Wdr47Q8CGF6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Wdr47Q8CGF6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Wdr47Q8CGF6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Wdr47Q8CGF6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Wdr47Q8CGF6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Wdr47Q8CGF6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Wdr47Q8CGF6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Wdr47Q8CGF6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Wdr47Q8CGF6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Wdr47Q8CGF6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Wdr47Q8CGF6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Wdr47Q8CGF6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Wdr47Q8CGF6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Wdr47Q8CGF6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Wdr47Q8CGF6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Wdr47Q8CGF6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Wdr47Q8CGF6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Wdr47Q8CGF6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Wdr47Q8CGF6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Wdr47Q8CGF6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Wdr47Q8CGF6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Wdr47Q8CGF6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Wdr47Q8CGF6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Wdr47Q8CGF6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Wdr47Q8CGF6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Wdr47Q8CGF6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Wdr47Q8CGF6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Wdr47Q8CGF6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Wdr47Q8CGF6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Wdr47Q8CGF6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Wdr47Q8CGF6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Wdr47Q8CGF6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Wdr47Q8CGF6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Wdr47Q8CGF6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Wdr47Q8CGF6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Wdr47Q8CGF6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Wdr47Q8CGF6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Wdr47Q8CGF6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Wdr47Q8CGF6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Wdr47Q8CGF6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Wdr47Q8CGF6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Wdr47Q8CGF6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Wdr47Q8CGF6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Wdr47Q8CGF6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Wdr47Q8CGF6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Wdr47Q8CGF6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Wdr47Q8CGF6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Wdr47Q8CGF6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Wdr47Q8CGF6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Wdr47Q8CGF6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Wdr47Q8CGF6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Wdr47Q8CGF6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Wdr47Q8CGF6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Wdr47Q8CGF6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Wdr47Q8CGF6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Wdr47Q8CGF6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Wdr47Q8CGF6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Wdr47Q8CGF6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Wdr47Q8CGF6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Wdr47Q8CGF6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Wdr47Q8CGF6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Wdr47Q8CGF6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Wdr47Q8CGF6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Wdr47Q8CGF6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Wdr47Q8CGF6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Wdr47Q8CGF6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Wdr47Q8CGF6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Wdr47Q8CGF6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Wdr47Q8CGF6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Wdr47Q8CGF6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Wdr47Q8CGF6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Wdr47Q8CGF6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Wdr47Q8CGF6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Wdr47Q8CGF6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Wdr47Q8CGF6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Wdr47Q8CGF6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Wdr47Q8CGF6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Wdr47Q8CGF6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Wdr47Q8CGF6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Wdr47Q8CGF6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Wdr47Q8CGF6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Wdr47Q8CGF6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Wdr47Q8CGF6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Wdr47Q8CGF6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Wdr47Q8CGF6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Wdr47Q8CGF6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Wdr47Q8CGF6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Wdr47Q8CGF6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Wdr47Q8CGF6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Wdr47Q8CGF6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Wdr47Q8CGF6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Wdr47Q8CGF6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Wdr47Q8CGF6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Wdr47Q8CGF6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Wdr47Q8CGF6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Wdr47Q8CGF6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Wdr47Q8CGF6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms