Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc43a2Q8CGA3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc43a2Q8CGA3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc43a2Q8CGA3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc43a2Q8CGA3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc43a2Q8CGA3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc43a2Q8CGA3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc43a2Q8CGA3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc43a2Q8CGA3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc43a2Q8CGA3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc43a2Q8CGA3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc43a2Q8CGA3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc43a2Q8CGA3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc43a2Q8CGA3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc43a2Q8CGA3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc43a2Q8CGA3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc43a2Q8CGA3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc43a2Q8CGA3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc43a2Q8CGA3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc43a2Q8CGA3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc43a2Q8CGA3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc43a2Q8CGA3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc43a2Q8CGA3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc43a2Q8CGA3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc43a2Q8CGA3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc43a2Q8CGA3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc43a2Q8CGA3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc43a2Q8CGA3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc43a2Q8CGA3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc43a2Q8CGA3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc43a2Q8CGA3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc43a2Q8CGA3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc43a2Q8CGA3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc43a2Q8CGA3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc43a2Q8CGA3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc43a2Q8CGA3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc43a2Q8CGA3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc43a2Q8CGA3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc43a2Q8CGA3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc43a2Q8CGA3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc43a2Q8CGA3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc43a2Q8CGA3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc43a2Q8CGA3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc43a2Q8CGA3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc43a2Q8CGA3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc43a2Q8CGA3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc43a2Q8CGA3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc43a2Q8CGA3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc43a2Q8CGA3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc43a2Q8CGA3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc43a2Q8CGA3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc43a2Q8CGA3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc43a2Q8CGA3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc43a2Q8CGA3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc43a2Q8CGA3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc43a2Q8CGA3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc43a2Q8CGA3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc43a2Q8CGA3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc43a2Q8CGA3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc43a2Q8CGA3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc43a2Q8CGA3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc43a2Q8CGA3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc43a2Q8CGA3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc43a2Q8CGA3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc43a2Q8CGA3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc43a2Q8CGA3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc43a2Q8CGA3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc43a2Q8CGA3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc43a2Q8CGA3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc43a2Q8CGA3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc43a2Q8CGA3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc43a2Q8CGA3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc43a2Q8CGA3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc43a2Q8CGA3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc43a2Q8CGA3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc43a2Q8CGA3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc43a2Q8CGA3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc43a2Q8CGA3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc43a2Q8CGA3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc43a2Q8CGA3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc43a2Q8CGA3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc43a2Q8CGA3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc43a2Q8CGA3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc43a2Q8CGA3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc43a2Q8CGA3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc43a2Q8CGA3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc43a2Q8CGA3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc43a2Q8CGA3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc43a2Q8CGA3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc43a2Q8CGA3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc43a2Q8CGA3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc43a2Q8CGA3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc43a2Q8CGA3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc43a2Q8CGA3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc43a2Q8CGA3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc43a2Q8CGA3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc43a2Q8CGA3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc43a2Q8CGA3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc43a2Q8CGA3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc43a2Q8CGA3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms