Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFC7

Clasrp, CLK4-associating serine/arginine rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClasrpQ8CFC7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ClasrpQ8CFC7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ClasrpQ8CFC7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ClasrpQ8CFC7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ClasrpQ8CFC7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ClasrpQ8CFC7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ClasrpQ8CFC7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ClasrpQ8CFC7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ClasrpQ8CFC7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ClasrpQ8CFC7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ClasrpQ8CFC7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ClasrpQ8CFC7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ClasrpQ8CFC7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ClasrpQ8CFC7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ClasrpQ8CFC7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ClasrpQ8CFC7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ClasrpQ8CFC7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ClasrpQ8CFC7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ClasrpQ8CFC7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ClasrpQ8CFC7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ClasrpQ8CFC7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ClasrpQ8CFC7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ClasrpQ8CFC7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ClasrpQ8CFC7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ClasrpQ8CFC7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ClasrpQ8CFC7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ClasrpQ8CFC7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ClasrpQ8CFC7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ClasrpQ8CFC7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ClasrpQ8CFC7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ClasrpQ8CFC7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ClasrpQ8CFC7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ClasrpQ8CFC7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ClasrpQ8CFC7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ClasrpQ8CFC7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ClasrpQ8CFC7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ClasrpQ8CFC7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ClasrpQ8CFC7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ClasrpQ8CFC7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ClasrpQ8CFC7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ClasrpQ8CFC7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ClasrpQ8CFC7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ClasrpQ8CFC7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ClasrpQ8CFC7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ClasrpQ8CFC7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ClasrpQ8CFC7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ClasrpQ8CFC7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ClasrpQ8CFC7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ClasrpQ8CFC7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ClasrpQ8CFC7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ClasrpQ8CFC7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ClasrpQ8CFC7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ClasrpQ8CFC7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ClasrpQ8CFC7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ClasrpQ8CFC7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ClasrpQ8CFC7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ClasrpQ8CFC7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ClasrpQ8CFC7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ClasrpQ8CFC7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ClasrpQ8CFC7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ClasrpQ8CFC7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ClasrpQ8CFC7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ClasrpQ8CFC7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ClasrpQ8CFC7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ClasrpQ8CFC7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ClasrpQ8CFC7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ClasrpQ8CFC7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ClasrpQ8CFC7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ClasrpQ8CFC7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ClasrpQ8CFC7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ClasrpQ8CFC7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ClasrpQ8CFC7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ClasrpQ8CFC7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ClasrpQ8CFC7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ClasrpQ8CFC7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ClasrpQ8CFC7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ClasrpQ8CFC7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ClasrpQ8CFC7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ClasrpQ8CFC7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ClasrpQ8CFC7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ClasrpQ8CFC7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ClasrpQ8CFC7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ClasrpQ8CFC7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ClasrpQ8CFC7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ClasrpQ8CFC7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ClasrpQ8CFC7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ClasrpQ8CFC7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ClasrpQ8CFC7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ClasrpQ8CFC7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ClasrpQ8CFC7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ClasrpQ8CFC7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ClasrpQ8CFC7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ClasrpQ8CFC7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ClasrpQ8CFC7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ClasrpQ8CFC7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ClasrpQ8CFC7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ClasrpQ8CFC7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ClasrpQ8CFC7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ClasrpQ8CFC7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ClasrpQ8CFC7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms