Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

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Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm9955Q8CEJ8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm9955Q8CEJ8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm9955Q8CEJ8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm9955Q8CEJ8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm9955Q8CEJ8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm9955Q8CEJ8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm9955Q8CEJ8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm9955Q8CEJ8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm9955Q8CEJ8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm9955Q8CEJ8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm9955Q8CEJ8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm9955Q8CEJ8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm9955Q8CEJ8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm9955Q8CEJ8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm9955Q8CEJ8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm9955Q8CEJ8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm9955Q8CEJ8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm9955Q8CEJ8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm9955Q8CEJ8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm9955Q8CEJ8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm9955Q8CEJ8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm9955Q8CEJ8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm9955Q8CEJ8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm9955Q8CEJ8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm9955Q8CEJ8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm9955Q8CEJ8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm9955Q8CEJ8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm9955Q8CEJ8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm9955Q8CEJ8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm9955Q8CEJ8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm9955Q8CEJ8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm9955Q8CEJ8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm9955Q8CEJ8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm9955Q8CEJ8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm9955Q8CEJ8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm9955Q8CEJ8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm9955Q8CEJ8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm9955Q8CEJ8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm9955Q8CEJ8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm9955Q8CEJ8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm9955Q8CEJ8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm9955Q8CEJ8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm9955Q8CEJ8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm9955Q8CEJ8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm9955Q8CEJ8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm9955Q8CEJ8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm9955Q8CEJ8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm9955Q8CEJ8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm9955Q8CEJ8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm9955Q8CEJ8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm9955Q8CEJ8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm9955Q8CEJ8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm9955Q8CEJ8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm9955Q8CEJ8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm9955Q8CEJ8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm9955Q8CEJ8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm9955Q8CEJ8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm9955Q8CEJ8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm9955Q8CEJ8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm9955Q8CEJ8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm9955Q8CEJ8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm9955Q8CEJ8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm9955Q8CEJ8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm9955Q8CEJ8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm9955Q8CEJ8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm9955Q8CEJ8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm9955Q8CEJ8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm9955Q8CEJ8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm9955Q8CEJ8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm9955Q8CEJ8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm9955Q8CEJ8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm9955Q8CEJ8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm9955Q8CEJ8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm9955Q8CEJ8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm9955Q8CEJ8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm9955Q8CEJ8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm9955Q8CEJ8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm9955Q8CEJ8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm9955Q8CEJ8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm9955Q8CEJ8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm9955Q8CEJ8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm9955Q8CEJ8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm9955Q8CEJ8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm9955Q8CEJ8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm9955Q8CEJ8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm9955Q8CEJ8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm9955Q8CEJ8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm9955Q8CEJ8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm9955Q8CEJ8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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