Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB19

Phtf2, Putative homeodomain transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf2Q8CB19 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Phtf2Q8CB19 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Phtf2Q8CB19 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Phtf2Q8CB19 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Phtf2Q8CB19 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Phtf2Q8CB19 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Phtf2Q8CB19 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Phtf2Q8CB19 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Phtf2Q8CB19 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Phtf2Q8CB19 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Phtf2Q8CB19 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Phtf2Q8CB19 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Phtf2Q8CB19 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Phtf2Q8CB19 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Phtf2Q8CB19 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Phtf2Q8CB19 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Phtf2Q8CB19 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Phtf2Q8CB19 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Phtf2Q8CB19 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Phtf2Q8CB19 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Phtf2Q8CB19 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Phtf2Q8CB19 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Phtf2Q8CB19 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Phtf2Q8CB19 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Phtf2Q8CB19 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Phtf2Q8CB19 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Phtf2Q8CB19 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Phtf2Q8CB19 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Phtf2Q8CB19 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Phtf2Q8CB19 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Phtf2Q8CB19 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Phtf2Q8CB19 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Phtf2Q8CB19 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Phtf2Q8CB19 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Phtf2Q8CB19 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Phtf2Q8CB19 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Phtf2Q8CB19 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Phtf2Q8CB19 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Phtf2Q8CB19 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Phtf2Q8CB19 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Phtf2Q8CB19 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Phtf2Q8CB19 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Phtf2Q8CB19 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Phtf2Q8CB19 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Phtf2Q8CB19 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Phtf2Q8CB19 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Phtf2Q8CB19 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Phtf2Q8CB19 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Phtf2Q8CB19 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Phtf2Q8CB19 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Phtf2Q8CB19 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Phtf2Q8CB19 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Phtf2Q8CB19 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Phtf2Q8CB19 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Phtf2Q8CB19 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Phtf2Q8CB19 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Phtf2Q8CB19 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Phtf2Q8CB19 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Phtf2Q8CB19 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Phtf2Q8CB19 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Phtf2Q8CB19 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Phtf2Q8CB19 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Phtf2Q8CB19 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Phtf2Q8CB19 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Phtf2Q8CB19 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Phtf2Q8CB19 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Phtf2Q8CB19 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Phtf2Q8CB19 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Phtf2Q8CB19 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Phtf2Q8CB19 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Phtf2Q8CB19 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Phtf2Q8CB19 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Phtf2Q8CB19 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Phtf2Q8CB19 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Phtf2Q8CB19 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Phtf2Q8CB19 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Phtf2Q8CB19 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Phtf2Q8CB19 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Phtf2Q8CB19 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Phtf2Q8CB19 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Phtf2Q8CB19 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Phtf2Q8CB19 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Phtf2Q8CB19 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Phtf2Q8CB19 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Phtf2Q8CB19 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Phtf2Q8CB19 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Phtf2Q8CB19 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Phtf2Q8CB19 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Phtf2Q8CB19 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Phtf2Q8CB19 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Phtf2Q8CB19 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Phtf2Q8CB19 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Phtf2Q8CB19 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Phtf2Q8CB19 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Phtf2Q8CB19 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Phtf2Q8CB19 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Phtf2Q8CB19 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Phtf2Q8CB19 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Phtf2Q8CB19 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Phtf2Q8CB19 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms