Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Apol7cQ8C6E1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Apol7cQ8C6E1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Apol7cQ8C6E1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Apol7cQ8C6E1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Apol7cQ8C6E1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Apol7cQ8C6E1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Apol7cQ8C6E1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Apol7cQ8C6E1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Apol7cQ8C6E1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Apol7cQ8C6E1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Apol7cQ8C6E1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Apol7cQ8C6E1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Apol7cQ8C6E1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Apol7cQ8C6E1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Apol7cQ8C6E1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Apol7cQ8C6E1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Apol7cQ8C6E1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Apol7cQ8C6E1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Apol7cQ8C6E1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Apol7cQ8C6E1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Apol7cQ8C6E1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Apol7cQ8C6E1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Apol7cQ8C6E1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Apol7cQ8C6E1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Apol7cQ8C6E1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Apol7cQ8C6E1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Apol7cQ8C6E1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Apol7cQ8C6E1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Apol7cQ8C6E1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Apol7cQ8C6E1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Apol7cQ8C6E1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apol7cQ8C6E1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apol7cQ8C6E1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apol7cQ8C6E1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Apol7cQ8C6E1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Apol7cQ8C6E1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Apol7cQ8C6E1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Apol7cQ8C6E1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Apol7cQ8C6E1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Apol7cQ8C6E1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Apol7cQ8C6E1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Apol7cQ8C6E1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Apol7cQ8C6E1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apol7cQ8C6E1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apol7cQ8C6E1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Apol7cQ8C6E1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Apol7cQ8C6E1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Apol7cQ8C6E1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apol7cQ8C6E1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apol7cQ8C6E1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apol7cQ8C6E1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apol7cQ8C6E1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Apol7cQ8C6E1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Apol7cQ8C6E1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Apol7cQ8C6E1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Apol7cQ8C6E1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Apol7cQ8C6E1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Apol7cQ8C6E1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Apol7cQ8C6E1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Apol7cQ8C6E1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Apol7cQ8C6E1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Apol7cQ8C6E1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apol7cQ8C6E1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apol7cQ8C6E1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apol7cQ8C6E1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apol7cQ8C6E1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apol7cQ8C6E1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apol7cQ8C6E1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apol7cQ8C6E1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Apol7cQ8C6E1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Apol7cQ8C6E1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Apol7cQ8C6E1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Apol7cQ8C6E1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Apol7cQ8C6E1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Apol7cQ8C6E1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Apol7cQ8C6E1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Apol7cQ8C6E1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Apol7cQ8C6E1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Apol7cQ8C6E1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Apol7cQ8C6E1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Apol7cQ8C6E1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Apol7cQ8C6E1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Apol7cQ8C6E1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Apol7cQ8C6E1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Apol7cQ8C6E1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Apol7cQ8C6E1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Apol7cQ8C6E1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Apol7cQ8C6E1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Apol7cQ8C6E1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Apol7cQ8C6E1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Apol7cQ8C6E1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Apol7cQ8C6E1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Apol7cQ8C6E1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Apol7cQ8C6E1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Apol7cQ8C6E1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25■■□□□ 1.59
Apol7cQ8C6E1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Apol7cQ8C6E1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Apol7cQ8C6E1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Apol7cQ8C6E1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms