Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube3dQ8BX13 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube3dQ8BX13 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube3dQ8BX13 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube3dQ8BX13 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube3dQ8BX13 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube3dQ8BX13 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube3dQ8BX13 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube3dQ8BX13 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube3dQ8BX13 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube3dQ8BX13 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube3dQ8BX13 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube3dQ8BX13 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube3dQ8BX13 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube3dQ8BX13 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3dQ8BX13 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3dQ8BX13 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3dQ8BX13 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3dQ8BX13 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3dQ8BX13 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ube3dQ8BX13 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ube3dQ8BX13 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ube3dQ8BX13 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ube3dQ8BX13 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3dQ8BX13 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3dQ8BX13 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ube3dQ8BX13 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube3dQ8BX13 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ube3dQ8BX13 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube3dQ8BX13 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube3dQ8BX13 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube3dQ8BX13 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube3dQ8BX13 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube3dQ8BX13 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube3dQ8BX13 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ube3dQ8BX13 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube3dQ8BX13 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube3dQ8BX13 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube3dQ8BX13 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ube3dQ8BX13 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ube3dQ8BX13 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ube3dQ8BX13 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube3dQ8BX13 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube3dQ8BX13 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ube3dQ8BX13 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ube3dQ8BX13 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ube3dQ8BX13 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ube3dQ8BX13 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube3dQ8BX13 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ube3dQ8BX13 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ube3dQ8BX13 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ube3dQ8BX13 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ube3dQ8BX13 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ube3dQ8BX13 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ube3dQ8BX13 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ube3dQ8BX13 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ube3dQ8BX13 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ube3dQ8BX13 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ube3dQ8BX13 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube3dQ8BX13 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ube3dQ8BX13 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ube3dQ8BX13 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ube3dQ8BX13 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ube3dQ8BX13 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ube3dQ8BX13 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ube3dQ8BX13 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ube3dQ8BX13 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ube3dQ8BX13 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ube3dQ8BX13 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ube3dQ8BX13 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ube3dQ8BX13 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ube3dQ8BX13 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ube3dQ8BX13 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ube3dQ8BX13 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ube3dQ8BX13 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ube3dQ8BX13 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ube3dQ8BX13 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ube3dQ8BX13 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ube3dQ8BX13 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ube3dQ8BX13 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ube3dQ8BX13 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ube3dQ8BX13 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ube3dQ8BX13 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ube3dQ8BX13 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube3dQ8BX13 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube3dQ8BX13 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube3dQ8BX13 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube3dQ8BX13 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube3dQ8BX13 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ube3dQ8BX13 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ube3dQ8BX13 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ube3dQ8BX13 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ube3dQ8BX13 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ube3dQ8BX13 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ube3dQ8BX13 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ube3dQ8BX13 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ube3dQ8BX13 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ube3dQ8BX13 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube3dQ8BX13 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube3dQ8BX13 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms