Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rd3Q8BRE0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rd3Q8BRE0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rd3Q8BRE0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rd3Q8BRE0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rd3Q8BRE0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rd3Q8BRE0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rd3Q8BRE0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rd3Q8BRE0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rd3Q8BRE0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rd3Q8BRE0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rd3Q8BRE0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rd3Q8BRE0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rd3Q8BRE0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rd3Q8BRE0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rd3Q8BRE0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rd3Q8BRE0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rd3Q8BRE0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rd3Q8BRE0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rd3Q8BRE0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rd3Q8BRE0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rd3Q8BRE0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Rd3Q8BRE0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Rd3Q8BRE0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rd3Q8BRE0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rd3Q8BRE0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rd3Q8BRE0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rd3Q8BRE0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rd3Q8BRE0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Rd3Q8BRE0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rd3Q8BRE0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rd3Q8BRE0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rd3Q8BRE0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rd3Q8BRE0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rd3Q8BRE0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rd3Q8BRE0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rd3Q8BRE0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rd3Q8BRE0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rd3Q8BRE0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rd3Q8BRE0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rd3Q8BRE0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rd3Q8BRE0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rd3Q8BRE0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rd3Q8BRE0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rd3Q8BRE0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rd3Q8BRE0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rd3Q8BRE0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rd3Q8BRE0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rd3Q8BRE0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rd3Q8BRE0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rd3Q8BRE0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rd3Q8BRE0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rd3Q8BRE0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rd3Q8BRE0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rd3Q8BRE0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rd3Q8BRE0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Rd3Q8BRE0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rd3Q8BRE0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rd3Q8BRE0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rd3Q8BRE0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rd3Q8BRE0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rd3Q8BRE0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rd3Q8BRE0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rd3Q8BRE0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rd3Q8BRE0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rd3Q8BRE0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rd3Q8BRE0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rd3Q8BRE0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rd3Q8BRE0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rd3Q8BRE0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rd3Q8BRE0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Rd3Q8BRE0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rd3Q8BRE0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rd3Q8BRE0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rd3Q8BRE0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rd3Q8BRE0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rd3Q8BRE0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rd3Q8BRE0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rd3Q8BRE0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rd3Q8BRE0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rd3Q8BRE0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rd3Q8BRE0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rd3Q8BRE0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rd3Q8BRE0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rd3Q8BRE0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Rd3Q8BRE0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rd3Q8BRE0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Rd3Q8BRE0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Rd3Q8BRE0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rd3Q8BRE0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rd3Q8BRE0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rd3Q8BRE0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rd3Q8BRE0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rd3Q8BRE0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rd3Q8BRE0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rd3Q8BRE0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rd3Q8BRE0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rd3Q8BRE0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rd3Q8BRE0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rd3Q8BRE0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms