Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ57

Gm10600, Predicted gene 10600, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10600Q8BQ57 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm10600Q8BQ57 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm10600Q8BQ57 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm10600Q8BQ57 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm10600Q8BQ57 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm10600Q8BQ57 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm10600Q8BQ57 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm10600Q8BQ57 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm10600Q8BQ57 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm10600Q8BQ57 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm10600Q8BQ57 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm10600Q8BQ57 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm10600Q8BQ57 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm10600Q8BQ57 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm10600Q8BQ57 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm10600Q8BQ57 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm10600Q8BQ57 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm10600Q8BQ57 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm10600Q8BQ57 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm10600Q8BQ57 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm10600Q8BQ57 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm10600Q8BQ57 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm10600Q8BQ57 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm10600Q8BQ57 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm10600Q8BQ57 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm10600Q8BQ57 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm10600Q8BQ57 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm10600Q8BQ57 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm10600Q8BQ57 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm10600Q8BQ57 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm10600Q8BQ57 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm10600Q8BQ57 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm10600Q8BQ57 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm10600Q8BQ57 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm10600Q8BQ57 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm10600Q8BQ57 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm10600Q8BQ57 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm10600Q8BQ57 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm10600Q8BQ57 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm10600Q8BQ57 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm10600Q8BQ57 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm10600Q8BQ57 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm10600Q8BQ57 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm10600Q8BQ57 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm10600Q8BQ57 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm10600Q8BQ57 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm10600Q8BQ57 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm10600Q8BQ57 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm10600Q8BQ57 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm10600Q8BQ57 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm10600Q8BQ57 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm10600Q8BQ57 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm10600Q8BQ57 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm10600Q8BQ57 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm10600Q8BQ57 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm10600Q8BQ57 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm10600Q8BQ57 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm10600Q8BQ57 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm10600Q8BQ57 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm10600Q8BQ57 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm10600Q8BQ57 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm10600Q8BQ57 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm10600Q8BQ57 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm10600Q8BQ57 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm10600Q8BQ57 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm10600Q8BQ57 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm10600Q8BQ57 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm10600Q8BQ57 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm10600Q8BQ57 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm10600Q8BQ57 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm10600Q8BQ57 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm10600Q8BQ57 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm10600Q8BQ57 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm10600Q8BQ57 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm10600Q8BQ57 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm10600Q8BQ57 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm10600Q8BQ57 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm10600Q8BQ57 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm10600Q8BQ57 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm10600Q8BQ57 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm10600Q8BQ57 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm10600Q8BQ57 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm10600Q8BQ57 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm10600Q8BQ57 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm10600Q8BQ57 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm10600Q8BQ57 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm10600Q8BQ57 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm10600Q8BQ57 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm10600Q8BQ57 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm10600Q8BQ57 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm10600Q8BQ57 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm10600Q8BQ57 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm10600Q8BQ57 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm10600Q8BQ57 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm10600Q8BQ57 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm10600Q8BQ57 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm10600Q8BQ57 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm10600Q8BQ57 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm10600Q8BQ57 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm10600Q8BQ57 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms