Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf3c4Q8BMQ2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf3c4Q8BMQ2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf3c4Q8BMQ2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtf3c4Q8BMQ2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf3c4Q8BMQ2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf3c4Q8BMQ2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtf3c4Q8BMQ2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtf3c4Q8BMQ2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtf3c4Q8BMQ2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtf3c4Q8BMQ2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtf3c4Q8BMQ2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gtf3c4Q8BMQ2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gtf3c4Q8BMQ2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtf3c4Q8BMQ2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtf3c4Q8BMQ2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf3c4Q8BMQ2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf3c4Q8BMQ2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf3c4Q8BMQ2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf3c4Q8BMQ2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf3c4Q8BMQ2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtf3c4Q8BMQ2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf3c4Q8BMQ2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf3c4Q8BMQ2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf3c4Q8BMQ2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtf3c4Q8BMQ2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf3c4Q8BMQ2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf3c4Q8BMQ2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf3c4Q8BMQ2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf3c4Q8BMQ2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf3c4Q8BMQ2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf3c4Q8BMQ2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf3c4Q8BMQ2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf3c4Q8BMQ2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf3c4Q8BMQ2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtf3c4Q8BMQ2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtf3c4Q8BMQ2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf3c4Q8BMQ2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf3c4Q8BMQ2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf3c4Q8BMQ2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf3c4Q8BMQ2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf3c4Q8BMQ2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtf3c4Q8BMQ2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf3c4Q8BMQ2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf3c4Q8BMQ2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf3c4Q8BMQ2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf3c4Q8BMQ2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf3c4Q8BMQ2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf3c4Q8BMQ2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf3c4Q8BMQ2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf3c4Q8BMQ2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf3c4Q8BMQ2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gtf3c4Q8BMQ2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtf3c4Q8BMQ2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf3c4Q8BMQ2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf3c4Q8BMQ2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf3c4Q8BMQ2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf3c4Q8BMQ2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf3c4Q8BMQ2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf3c4Q8BMQ2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf3c4Q8BMQ2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf3c4Q8BMQ2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtf3c4Q8BMQ2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gtf3c4Q8BMQ2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gtf3c4Q8BMQ2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtf3c4Q8BMQ2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtf3c4Q8BMQ2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf3c4Q8BMQ2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf3c4Q8BMQ2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf3c4Q8BMQ2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf3c4Q8BMQ2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtf3c4Q8BMQ2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf3c4Q8BMQ2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf3c4Q8BMQ2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf3c4Q8BMQ2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf3c4Q8BMQ2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf3c4Q8BMQ2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf3c4Q8BMQ2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf3c4Q8BMQ2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf3c4Q8BMQ2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtf3c4Q8BMQ2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtf3c4Q8BMQ2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf3c4Q8BMQ2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf3c4Q8BMQ2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf3c4Q8BMQ2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf3c4Q8BMQ2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf3c4Q8BMQ2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf3c4Q8BMQ2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf3c4Q8BMQ2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms