Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zcchc4Q8BKW4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zcchc4Q8BKW4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zcchc4Q8BKW4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zcchc4Q8BKW4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zcchc4Q8BKW4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zcchc4Q8BKW4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zcchc4Q8BKW4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zcchc4Q8BKW4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Zcchc4Q8BKW4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zcchc4Q8BKW4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zcchc4Q8BKW4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zcchc4Q8BKW4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zcchc4Q8BKW4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zcchc4Q8BKW4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zcchc4Q8BKW4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zcchc4Q8BKW4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zcchc4Q8BKW4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zcchc4Q8BKW4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zcchc4Q8BKW4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zcchc4Q8BKW4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zcchc4Q8BKW4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zcchc4Q8BKW4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zcchc4Q8BKW4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zcchc4Q8BKW4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zcchc4Q8BKW4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zcchc4Q8BKW4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zcchc4Q8BKW4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zcchc4Q8BKW4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zcchc4Q8BKW4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zcchc4Q8BKW4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zcchc4Q8BKW4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zcchc4Q8BKW4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zcchc4Q8BKW4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Zcchc4Q8BKW4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Zcchc4Q8BKW4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zcchc4Q8BKW4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zcchc4Q8BKW4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zcchc4Q8BKW4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zcchc4Q8BKW4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zcchc4Q8BKW4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zcchc4Q8BKW4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zcchc4Q8BKW4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zcchc4Q8BKW4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zcchc4Q8BKW4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zcchc4Q8BKW4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zcchc4Q8BKW4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zcchc4Q8BKW4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zcchc4Q8BKW4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zcchc4Q8BKW4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zcchc4Q8BKW4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zcchc4Q8BKW4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zcchc4Q8BKW4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zcchc4Q8BKW4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zcchc4Q8BKW4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zcchc4Q8BKW4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zcchc4Q8BKW4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zcchc4Q8BKW4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zcchc4Q8BKW4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zcchc4Q8BKW4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zcchc4Q8BKW4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zcchc4Q8BKW4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zcchc4Q8BKW4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zcchc4Q8BKW4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zcchc4Q8BKW4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zcchc4Q8BKW4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zcchc4Q8BKW4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zcchc4Q8BKW4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zcchc4Q8BKW4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zcchc4Q8BKW4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zcchc4Q8BKW4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zcchc4Q8BKW4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zcchc4Q8BKW4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zcchc4Q8BKW4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zcchc4Q8BKW4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zcchc4Q8BKW4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zcchc4Q8BKW4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zcchc4Q8BKW4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zcchc4Q8BKW4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zcchc4Q8BKW4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zcchc4Q8BKW4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zcchc4Q8BKW4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zcchc4Q8BKW4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zcchc4Q8BKW4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zcchc4Q8BKW4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zcchc4Q8BKW4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zcchc4Q8BKW4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zcchc4Q8BKW4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zcchc4Q8BKW4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zcchc4Q8BKW4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zcchc4Q8BKW4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zcchc4Q8BKW4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zcchc4Q8BKW4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zcchc4Q8BKW4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zcchc4Q8BKW4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zcchc4Q8BKW4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zcchc4Q8BKW4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zcchc4Q8BKW4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zcchc4Q8BKW4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zcchc4Q8BKW4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms