Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q8BGC1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q8BGC1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q8BGC1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q8BGC1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q8BGC1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Q8BGC1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q8BGC1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q8BGC1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q8BGC1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q8BGC1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q8BGC1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Q8BGC1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q8BGC1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q8BGC1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q8BGC1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q8BGC1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q8BGC1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Q8BGC1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q8BGC1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q8BGC1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q8BGC1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q8BGC1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q8BGC1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q8BGC1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q8BGC1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q8BGC1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q8BGC1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q8BGC1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q8BGC1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q8BGC1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q8BGC1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q8BGC1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q8BGC1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q8BGC1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q8BGC1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q8BGC1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q8BGC1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q8BGC1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q8BGC1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q8BGC1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q8BGC1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q8BGC1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q8BGC1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Q8BGC1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q8BGC1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Q8BGC1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q8BGC1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q8BGC1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q8BGC1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q8BGC1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q8BGC1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q8BGC1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q8BGC1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Q8BGC1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q8BGC1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q8BGC1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q8BGC1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q8BGC1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q8BGC1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q8BGC1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q8BGC1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q8BGC1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q8BGC1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q8BGC1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q8BGC1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q8BGC1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q8BGC1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q8BGC1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q8BGC1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q8BGC1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q8BGC1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q8BGC1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q8BGC1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q8BGC1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q8BGC1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q8BGC1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q8BGC1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q8BGC1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q8BGC1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q8BGC1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q8BGC1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q8BGC1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Q8BGC1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q8BGC1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q8BGC1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q8BGC1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q8BGC1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q8BGC1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q8BGC1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q8BGC1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q8BGC1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q8BGC1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q8BGC1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q8BGC1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q8BGC1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q8BGC1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q8BGC1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q8BGC1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Q8BGC1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms