Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG73

Sh3bgrl2, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 2, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl2Q8BG73 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bgrl2Q8BG73 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bgrl2Q8BG73 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bgrl2Q8BG73 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bgrl2Q8BG73 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bgrl2Q8BG73 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bgrl2Q8BG73 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bgrl2Q8BG73 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bgrl2Q8BG73 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bgrl2Q8BG73 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bgrl2Q8BG73 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bgrl2Q8BG73 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bgrl2Q8BG73 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bgrl2Q8BG73 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3bgrl2Q8BG73 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3bgrl2Q8BG73 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bgrl2Q8BG73 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bgrl2Q8BG73 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bgrl2Q8BG73 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sh3bgrl2Q8BG73 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh3bgrl2Q8BG73 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh3bgrl2Q8BG73 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh3bgrl2Q8BG73 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bgrl2Q8BG73 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bgrl2Q8BG73 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bgrl2Q8BG73 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bgrl2Q8BG73 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bgrl2Q8BG73 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh3bgrl2Q8BG73 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bgrl2Q8BG73 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bgrl2Q8BG73 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh3bgrl2Q8BG73 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bgrl2Q8BG73 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bgrl2Q8BG73 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bgrl2Q8BG73 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh3bgrl2Q8BG73 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bgrl2Q8BG73 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bgrl2Q8BG73 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bgrl2Q8BG73 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bgrl2Q8BG73 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bgrl2Q8BG73 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bgrl2Q8BG73 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bgrl2Q8BG73 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bgrl2Q8BG73 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bgrl2Q8BG73 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bgrl2Q8BG73 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bgrl2Q8BG73 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bgrl2Q8BG73 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bgrl2Q8BG73 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bgrl2Q8BG73 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bgrl2Q8BG73 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bgrl2Q8BG73 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bgrl2Q8BG73 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bgrl2Q8BG73 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bgrl2Q8BG73 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bgrl2Q8BG73 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bgrl2Q8BG73 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bgrl2Q8BG73 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bgrl2Q8BG73 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bgrl2Q8BG73 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bgrl2Q8BG73 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bgrl2Q8BG73 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bgrl2Q8BG73 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bgrl2Q8BG73 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bgrl2Q8BG73 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bgrl2Q8BG73 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bgrl2Q8BG73 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bgrl2Q8BG73 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3bgrl2Q8BG73 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3bgrl2Q8BG73 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bgrl2Q8BG73 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bgrl2Q8BG73 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bgrl2Q8BG73 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bgrl2Q8BG73 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bgrl2Q8BG73 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bgrl2Q8BG73 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bgrl2Q8BG73 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bgrl2Q8BG73 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bgrl2Q8BG73 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bgrl2Q8BG73 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bgrl2Q8BG73 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bgrl2Q8BG73 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bgrl2Q8BG73 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bgrl2Q8BG73 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bgrl2Q8BG73 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bgrl2Q8BG73 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bgrl2Q8BG73 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bgrl2Q8BG73 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bgrl2Q8BG73 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bgrl2Q8BG73 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bgrl2Q8BG73 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bgrl2Q8BG73 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms