Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF4

Sdccag8, Serologically defined colon cancer antigen 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag8Q80UF4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sdccag8Q80UF4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sdccag8Q80UF4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sdccag8Q80UF4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sdccag8Q80UF4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sdccag8Q80UF4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sdccag8Q80UF4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sdccag8Q80UF4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sdccag8Q80UF4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Sdccag8Q80UF4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Sdccag8Q80UF4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sdccag8Q80UF4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sdccag8Q80UF4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sdccag8Q80UF4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sdccag8Q80UF4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sdccag8Q80UF4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sdccag8Q80UF4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sdccag8Q80UF4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sdccag8Q80UF4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sdccag8Q80UF4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sdccag8Q80UF4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sdccag8Q80UF4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sdccag8Q80UF4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sdccag8Q80UF4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sdccag8Q80UF4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sdccag8Q80UF4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sdccag8Q80UF4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Sdccag8Q80UF4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sdccag8Q80UF4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Sdccag8Q80UF4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Sdccag8Q80UF4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sdccag8Q80UF4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sdccag8Q80UF4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sdccag8Q80UF4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sdccag8Q80UF4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sdccag8Q80UF4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sdccag8Q80UF4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sdccag8Q80UF4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sdccag8Q80UF4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sdccag8Q80UF4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sdccag8Q80UF4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sdccag8Q80UF4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sdccag8Q80UF4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sdccag8Q80UF4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sdccag8Q80UF4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sdccag8Q80UF4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sdccag8Q80UF4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sdccag8Q80UF4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sdccag8Q80UF4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sdccag8Q80UF4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sdccag8Q80UF4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Sdccag8Q80UF4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Sdccag8Q80UF4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Sdccag8Q80UF4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sdccag8Q80UF4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sdccag8Q80UF4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sdccag8Q80UF4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sdccag8Q80UF4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sdccag8Q80UF4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sdccag8Q80UF4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sdccag8Q80UF4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sdccag8Q80UF4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sdccag8Q80UF4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Sdccag8Q80UF4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sdccag8Q80UF4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sdccag8Q80UF4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sdccag8Q80UF4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sdccag8Q80UF4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sdccag8Q80UF4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sdccag8Q80UF4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sdccag8Q80UF4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sdccag8Q80UF4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sdccag8Q80UF4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sdccag8Q80UF4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sdccag8Q80UF4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sdccag8Q80UF4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sdccag8Q80UF4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sdccag8Q80UF4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sdccag8Q80UF4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sdccag8Q80UF4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sdccag8Q80UF4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sdccag8Q80UF4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sdccag8Q80UF4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sdccag8Q80UF4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sdccag8Q80UF4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sdccag8Q80UF4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sdccag8Q80UF4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sdccag8Q80UF4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sdccag8Q80UF4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sdccag8Q80UF4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sdccag8Q80UF4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sdccag8Q80UF4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sdccag8Q80UF4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sdccag8Q80UF4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sdccag8Q80UF4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sdccag8Q80UF4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sdccag8Q80UF4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sdccag8Q80UF4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sdccag8Q80UF4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sdccag8Q80UF4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.9 ms