Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp8Q80U87 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp8Q80U87 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp8Q80U87 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp8Q80U87 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp8Q80U87 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp8Q80U87 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp8Q80U87 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp8Q80U87 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp8Q80U87 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp8Q80U87 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp8Q80U87 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp8Q80U87 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp8Q80U87 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp8Q80U87 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp8Q80U87 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp8Q80U87 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp8Q80U87 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp8Q80U87 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp8Q80U87 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp8Q80U87 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp8Q80U87 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp8Q80U87 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Usp8Q80U87 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp8Q80U87 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp8Q80U87 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp8Q80U87 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp8Q80U87 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp8Q80U87 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp8Q80U87 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp8Q80U87 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp8Q80U87 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp8Q80U87 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp8Q80U87 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp8Q80U87 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp8Q80U87 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp8Q80U87 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp8Q80U87 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp8Q80U87 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp8Q80U87 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp8Q80U87 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp8Q80U87 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp8Q80U87 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp8Q80U87 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp8Q80U87 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp8Q80U87 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp8Q80U87 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp8Q80U87 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp8Q80U87 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp8Q80U87 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp8Q80U87 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp8Q80U87 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp8Q80U87 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp8Q80U87 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp8Q80U87 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp8Q80U87 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp8Q80U87 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp8Q80U87 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp8Q80U87 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp8Q80U87 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp8Q80U87 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp8Q80U87 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp8Q80U87 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp8Q80U87 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Usp8Q80U87 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp8Q80U87 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp8Q80U87 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp8Q80U87 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp8Q80U87 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp8Q80U87 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp8Q80U87 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp8Q80U87 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp8Q80U87 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp8Q80U87 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp8Q80U87 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp8Q80U87 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp8Q80U87 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp8Q80U87 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp8Q80U87 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp8Q80U87 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp8Q80U87 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp8Q80U87 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp8Q80U87 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp8Q80U87 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp8Q80U87 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp8Q80U87 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp8Q80U87 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp8Q80U87 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp8Q80U87 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp8Q80U87 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp8Q80U87 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp8Q80U87 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp8Q80U87 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp8Q80U87 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp8Q80U87 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp8Q80U87 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp8Q80U87 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp8Q80U87 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp8Q80U87 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp8Q80U87 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms