Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pja2Q80U04 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pja2Q80U04 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pja2Q80U04 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pja2Q80U04 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pja2Q80U04 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pja2Q80U04 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pja2Q80U04 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pja2Q80U04 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pja2Q80U04 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pja2Q80U04 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pja2Q80U04 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pja2Q80U04 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pja2Q80U04 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pja2Q80U04 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pja2Q80U04 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pja2Q80U04 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pja2Q80U04 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pja2Q80U04 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pja2Q80U04 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Pja2Q80U04 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pja2Q80U04 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pja2Q80U04 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pja2Q80U04 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pja2Q80U04 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pja2Q80U04 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pja2Q80U04 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pja2Q80U04 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pja2Q80U04 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pja2Q80U04 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pja2Q80U04 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pja2Q80U04 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pja2Q80U04 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pja2Q80U04 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pja2Q80U04 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pja2Q80U04 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pja2Q80U04 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pja2Q80U04 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pja2Q80U04 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pja2Q80U04 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pja2Q80U04 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Pja2Q80U04 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pja2Q80U04 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pja2Q80U04 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pja2Q80U04 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pja2Q80U04 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pja2Q80U04 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pja2Q80U04 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pja2Q80U04 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pja2Q80U04 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pja2Q80U04 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pja2Q80U04 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pja2Q80U04 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pja2Q80U04 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pja2Q80U04 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pja2Q80U04 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pja2Q80U04 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pja2Q80U04 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pja2Q80U04 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pja2Q80U04 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pja2Q80U04 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pja2Q80U04 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pja2Q80U04 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pja2Q80U04 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pja2Q80U04 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pja2Q80U04 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pja2Q80U04 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pja2Q80U04 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pja2Q80U04 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pja2Q80U04 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pja2Q80U04 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pja2Q80U04 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pja2Q80U04 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pja2Q80U04 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pja2Q80U04 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pja2Q80U04 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pja2Q80U04 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pja2Q80U04 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pja2Q80U04 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pja2Q80U04 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pja2Q80U04 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pja2Q80U04 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pja2Q80U04 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pja2Q80U04 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Pja2Q80U04 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pja2Q80U04 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pja2Q80U04 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pja2Q80U04 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pja2Q80U04 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pja2Q80U04 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pja2Q80U04 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pja2Q80U04 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pja2Q80U04 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Pja2Q80U04 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pja2Q80U04 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pja2Q80U04 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pja2Q80U04 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pja2Q80U04 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pja2Q80U04 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pja2Q80U04 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms