Protein–RNA interactions for Protein: Q80T74

Klhl29, Kelch-like protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl29Q80T74 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Klhl29Q80T74 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Klhl29Q80T74 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Klhl29Q80T74 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Klhl29Q80T74 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Klhl29Q80T74 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Klhl29Q80T74 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Klhl29Q80T74 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Klhl29Q80T74 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Klhl29Q80T74 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Klhl29Q80T74 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Klhl29Q80T74 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Klhl29Q80T74 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Klhl29Q80T74 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Klhl29Q80T74 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Klhl29Q80T74 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Klhl29Q80T74 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Klhl29Q80T74 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Klhl29Q80T74 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Klhl29Q80T74 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Klhl29Q80T74 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Klhl29Q80T74 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Klhl29Q80T74 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Klhl29Q80T74 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Klhl29Q80T74 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Klhl29Q80T74 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Klhl29Q80T74 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Klhl29Q80T74 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Klhl29Q80T74 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Klhl29Q80T74 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Klhl29Q80T74 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Klhl29Q80T74 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Klhl29Q80T74 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Klhl29Q80T74 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Klhl29Q80T74 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klhl29Q80T74 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klhl29Q80T74 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klhl29Q80T74 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klhl29Q80T74 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klhl29Q80T74 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klhl29Q80T74 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klhl29Q80T74 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Klhl29Q80T74 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Klhl29Q80T74 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Klhl29Q80T74 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Klhl29Q80T74 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Klhl29Q80T74 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klhl29Q80T74 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klhl29Q80T74 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Klhl29Q80T74 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Klhl29Q80T74 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Klhl29Q80T74 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Klhl29Q80T74 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klhl29Q80T74 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klhl29Q80T74 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klhl29Q80T74 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klhl29Q80T74 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klhl29Q80T74 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klhl29Q80T74 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klhl29Q80T74 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Klhl29Q80T74 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Klhl29Q80T74 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Klhl29Q80T74 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Klhl29Q80T74 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl29Q80T74 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl29Q80T74 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl29Q80T74 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Klhl29Q80T74 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Klhl29Q80T74 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klhl29Q80T74 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klhl29Q80T74 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klhl29Q80T74 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klhl29Q80T74 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klhl29Q80T74 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klhl29Q80T74 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klhl29Q80T74 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klhl29Q80T74 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klhl29Q80T74 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Klhl29Q80T74 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Klhl29Q80T74 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klhl29Q80T74 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Klhl29Q80T74 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klhl29Q80T74 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klhl29Q80T74 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klhl29Q80T74 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Klhl29Q80T74 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Klhl29Q80T74 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Klhl29Q80T74 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Klhl29Q80T74 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klhl29Q80T74 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klhl29Q80T74 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klhl29Q80T74 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klhl29Q80T74 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klhl29Q80T74 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klhl29Q80T74 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klhl29Q80T74 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klhl29Q80T74 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Klhl29Q80T74 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Klhl29Q80T74 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Klhl29Q80T74 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms