Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim17Q7TPM3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim17Q7TPM3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim17Q7TPM3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim17Q7TPM3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim17Q7TPM3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim17Q7TPM3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim17Q7TPM3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim17Q7TPM3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim17Q7TPM3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim17Q7TPM3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim17Q7TPM3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim17Q7TPM3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim17Q7TPM3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim17Q7TPM3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim17Q7TPM3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim17Q7TPM3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim17Q7TPM3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim17Q7TPM3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim17Q7TPM3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim17Q7TPM3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim17Q7TPM3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim17Q7TPM3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim17Q7TPM3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim17Q7TPM3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim17Q7TPM3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim17Q7TPM3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim17Q7TPM3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim17Q7TPM3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim17Q7TPM3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim17Q7TPM3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim17Q7TPM3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim17Q7TPM3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim17Q7TPM3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim17Q7TPM3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim17Q7TPM3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim17Q7TPM3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim17Q7TPM3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim17Q7TPM3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim17Q7TPM3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim17Q7TPM3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim17Q7TPM3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim17Q7TPM3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim17Q7TPM3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim17Q7TPM3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim17Q7TPM3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim17Q7TPM3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim17Q7TPM3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim17Q7TPM3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim17Q7TPM3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim17Q7TPM3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim17Q7TPM3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim17Q7TPM3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim17Q7TPM3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim17Q7TPM3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim17Q7TPM3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim17Q7TPM3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trim17Q7TPM3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim17Q7TPM3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim17Q7TPM3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim17Q7TPM3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim17Q7TPM3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim17Q7TPM3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim17Q7TPM3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim17Q7TPM3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim17Q7TPM3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim17Q7TPM3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim17Q7TPM3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim17Q7TPM3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim17Q7TPM3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim17Q7TPM3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim17Q7TPM3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim17Q7TPM3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim17Q7TPM3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim17Q7TPM3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim17Q7TPM3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim17Q7TPM3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim17Q7TPM3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim17Q7TPM3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim17Q7TPM3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim17Q7TPM3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim17Q7TPM3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim17Q7TPM3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim17Q7TPM3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim17Q7TPM3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim17Q7TPM3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim17Q7TPM3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim17Q7TPM3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim17Q7TPM3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim17Q7TPM3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim17Q7TPM3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim17Q7TPM3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim17Q7TPM3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim17Q7TPM3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim17Q7TPM3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim17Q7TPM3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim17Q7TPM3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim17Q7TPM3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim17Q7TPM3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim17Q7TPM3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms