Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smim12Q78RX3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smim12Q78RX3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smim12Q78RX3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Smim12Q78RX3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smim12Q78RX3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smim12Q78RX3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smim12Q78RX3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smim12Q78RX3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smim12Q78RX3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smim12Q78RX3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smim12Q78RX3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smim12Q78RX3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Smim12Q78RX3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smim12Q78RX3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smim12Q78RX3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Smim12Q78RX3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smim12Q78RX3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smim12Q78RX3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smim12Q78RX3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smim12Q78RX3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smim12Q78RX3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smim12Q78RX3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smim12Q78RX3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smim12Q78RX3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smim12Q78RX3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smim12Q78RX3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smim12Q78RX3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smim12Q78RX3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smim12Q78RX3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smim12Q78RX3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smim12Q78RX3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smim12Q78RX3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smim12Q78RX3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smim12Q78RX3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smim12Q78RX3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Smim12Q78RX3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smim12Q78RX3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smim12Q78RX3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smim12Q78RX3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smim12Q78RX3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smim12Q78RX3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smim12Q78RX3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smim12Q78RX3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smim12Q78RX3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smim12Q78RX3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smim12Q78RX3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smim12Q78RX3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smim12Q78RX3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smim12Q78RX3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smim12Q78RX3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smim12Q78RX3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smim12Q78RX3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smim12Q78RX3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smim12Q78RX3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smim12Q78RX3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smim12Q78RX3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smim12Q78RX3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smim12Q78RX3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smim12Q78RX3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smim12Q78RX3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smim12Q78RX3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smim12Q78RX3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim12Q78RX3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim12Q78RX3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Smim12Q78RX3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smim12Q78RX3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smim12Q78RX3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smim12Q78RX3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smim12Q78RX3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim12Q78RX3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim12Q78RX3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smim12Q78RX3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smim12Q78RX3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smim12Q78RX3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smim12Q78RX3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smim12Q78RX3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smim12Q78RX3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smim12Q78RX3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smim12Q78RX3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smim12Q78RX3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smim12Q78RX3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smim12Q78RX3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smim12Q78RX3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smim12Q78RX3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smim12Q78RX3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smim12Q78RX3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smim12Q78RX3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smim12Q78RX3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smim12Q78RX3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smim12Q78RX3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim12Q78RX3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim12Q78RX3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim12Q78RX3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim12Q78RX3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smim12Q78RX3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smim12Q78RX3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smim12Q78RX3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smim12Q78RX3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smim12Q78RX3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms