Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ38

Cand1, Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cand1Q6ZQ38 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cand1Q6ZQ38 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cand1Q6ZQ38 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cand1Q6ZQ38 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cand1Q6ZQ38 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cand1Q6ZQ38 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cand1Q6ZQ38 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Cand1Q6ZQ38 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cand1Q6ZQ38 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cand1Q6ZQ38 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cand1Q6ZQ38 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cand1Q6ZQ38 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cand1Q6ZQ38 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cand1Q6ZQ38 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cand1Q6ZQ38 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cand1Q6ZQ38 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cand1Q6ZQ38 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cand1Q6ZQ38 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cand1Q6ZQ38 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cand1Q6ZQ38 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cand1Q6ZQ38 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cand1Q6ZQ38 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cand1Q6ZQ38 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cand1Q6ZQ38 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cand1Q6ZQ38 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cand1Q6ZQ38 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cand1Q6ZQ38 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cand1Q6ZQ38 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cand1Q6ZQ38 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cand1Q6ZQ38 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cand1Q6ZQ38 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cand1Q6ZQ38 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cand1Q6ZQ38 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cand1Q6ZQ38 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cand1Q6ZQ38 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cand1Q6ZQ38 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cand1Q6ZQ38 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cand1Q6ZQ38 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cand1Q6ZQ38 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cand1Q6ZQ38 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cand1Q6ZQ38 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cand1Q6ZQ38 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cand1Q6ZQ38 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cand1Q6ZQ38 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cand1Q6ZQ38 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cand1Q6ZQ38 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cand1Q6ZQ38 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cand1Q6ZQ38 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cand1Q6ZQ38 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cand1Q6ZQ38 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cand1Q6ZQ38 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cand1Q6ZQ38 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cand1Q6ZQ38 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cand1Q6ZQ38 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cand1Q6ZQ38 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cand1Q6ZQ38 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cand1Q6ZQ38 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cand1Q6ZQ38 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cand1Q6ZQ38 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cand1Q6ZQ38 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cand1Q6ZQ38 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cand1Q6ZQ38 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cand1Q6ZQ38 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cand1Q6ZQ38 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cand1Q6ZQ38 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cand1Q6ZQ38 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cand1Q6ZQ38 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cand1Q6ZQ38 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cand1Q6ZQ38 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cand1Q6ZQ38 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cand1Q6ZQ38 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cand1Q6ZQ38 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cand1Q6ZQ38 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cand1Q6ZQ38 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cand1Q6ZQ38 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cand1Q6ZQ38 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cand1Q6ZQ38 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cand1Q6ZQ38 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cand1Q6ZQ38 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cand1Q6ZQ38 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cand1Q6ZQ38 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cand1Q6ZQ38 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cand1Q6ZQ38 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cand1Q6ZQ38 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cand1Q6ZQ38 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cand1Q6ZQ38 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cand1Q6ZQ38 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cand1Q6ZQ38 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cand1Q6ZQ38 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cand1Q6ZQ38 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cand1Q6ZQ38 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cand1Q6ZQ38 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cand1Q6ZQ38 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cand1Q6ZQ38 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cand1Q6ZQ38 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cand1Q6ZQ38 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cand1Q6ZQ38 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cand1Q6ZQ38 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cand1Q6ZQ38 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cand1Q6ZQ38 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms