Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ssxb10Q6XAR7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ssxb10Q6XAR7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ssxb10Q6XAR7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ssxb10Q6XAR7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ssxb10Q6XAR7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ssxb10Q6XAR7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ssxb10Q6XAR7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ssxb10Q6XAR7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ssxb10Q6XAR7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ssxb10Q6XAR7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ssxb10Q6XAR7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ssxb10Q6XAR7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ssxb10Q6XAR7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ssxb10Q6XAR7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ssxb10Q6XAR7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ssxb10Q6XAR7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ssxb10Q6XAR7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ssxb10Q6XAR7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ssxb10Q6XAR7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ssxb10Q6XAR7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ssxb10Q6XAR7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ssxb10Q6XAR7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ssxb10Q6XAR7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ssxb10Q6XAR7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ssxb10Q6XAR7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ssxb10Q6XAR7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ssxb10Q6XAR7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ssxb10Q6XAR7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ssxb10Q6XAR7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ssxb10Q6XAR7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ssxb10Q6XAR7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ssxb10Q6XAR7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ssxb10Q6XAR7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ssxb10Q6XAR7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ssxb10Q6XAR7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ssxb10Q6XAR7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ssxb10Q6XAR7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ssxb10Q6XAR7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ssxb10Q6XAR7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ssxb10Q6XAR7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ssxb10Q6XAR7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ssxb10Q6XAR7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ssxb10Q6XAR7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ssxb10Q6XAR7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ssxb10Q6XAR7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ssxb10Q6XAR7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ssxb10Q6XAR7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ssxb10Q6XAR7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ssxb10Q6XAR7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ssxb10Q6XAR7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ssxb10Q6XAR7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ssxb10Q6XAR7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ssxb10Q6XAR7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ssxb10Q6XAR7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ssxb10Q6XAR7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ssxb10Q6XAR7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ssxb10Q6XAR7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ssxb10Q6XAR7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ssxb10Q6XAR7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ssxb10Q6XAR7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ssxb10Q6XAR7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ssxb10Q6XAR7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ssxb10Q6XAR7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ssxb10Q6XAR7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ssxb10Q6XAR7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ssxb10Q6XAR7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ssxb10Q6XAR7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ssxb10Q6XAR7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ssxb10Q6XAR7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ssxb10Q6XAR7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ssxb10Q6XAR7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ssxb10Q6XAR7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ssxb10Q6XAR7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ssxb10Q6XAR7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ssxb10Q6XAR7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ssxb10Q6XAR7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ssxb10Q6XAR7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ssxb10Q6XAR7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ssxb10Q6XAR7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ssxb10Q6XAR7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ssxb10Q6XAR7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ssxb10Q6XAR7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ssxb10Q6XAR7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ssxb10Q6XAR7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ssxb10Q6XAR7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ssxb10Q6XAR7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ssxb10Q6XAR7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ssxb10Q6XAR7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ssxb10Q6XAR7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ssxb10Q6XAR7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ssxb10Q6XAR7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ssxb10Q6XAR7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ssxb10Q6XAR7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ssxb10Q6XAR7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ssxb10Q6XAR7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ssxb10Q6XAR7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ssxb10Q6XAR7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ssxb10Q6XAR7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ssxb10Q6XAR7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms