Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cxcl3Q6W5C0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cxcl3Q6W5C0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cxcl3Q6W5C0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cxcl3Q6W5C0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cxcl3Q6W5C0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cxcl3Q6W5C0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cxcl3Q6W5C0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cxcl3Q6W5C0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcl3Q6W5C0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcl3Q6W5C0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcl3Q6W5C0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cxcl3Q6W5C0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cxcl3Q6W5C0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cxcl3Q6W5C0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cxcl3Q6W5C0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cxcl3Q6W5C0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxcl3Q6W5C0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxcl3Q6W5C0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxcl3Q6W5C0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxcl3Q6W5C0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxcl3Q6W5C0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxcl3Q6W5C0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxcl3Q6W5C0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cxcl3Q6W5C0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cxcl3Q6W5C0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cxcl3Q6W5C0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cxcl3Q6W5C0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cxcl3Q6W5C0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cxcl3Q6W5C0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cxcl3Q6W5C0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cxcl3Q6W5C0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cxcl3Q6W5C0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cxcl3Q6W5C0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cxcl3Q6W5C0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cxcl3Q6W5C0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cxcl3Q6W5C0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cxcl3Q6W5C0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cxcl3Q6W5C0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cxcl3Q6W5C0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cxcl3Q6W5C0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cxcl3Q6W5C0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cxcl3Q6W5C0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cxcl3Q6W5C0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cxcl3Q6W5C0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cxcl3Q6W5C0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cxcl3Q6W5C0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cxcl3Q6W5C0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cxcl3Q6W5C0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cxcl3Q6W5C0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cxcl3Q6W5C0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxcl3Q6W5C0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxcl3Q6W5C0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxcl3Q6W5C0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxcl3Q6W5C0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cxcl3Q6W5C0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cxcl3Q6W5C0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cxcl3Q6W5C0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cxcl3Q6W5C0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cxcl3Q6W5C0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cxcl3Q6W5C0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cxcl3Q6W5C0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cxcl3Q6W5C0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cxcl3Q6W5C0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cxcl3Q6W5C0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cxcl3Q6W5C0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cxcl3Q6W5C0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cxcl3Q6W5C0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cxcl3Q6W5C0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cxcl3Q6W5C0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cxcl3Q6W5C0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxcl3Q6W5C0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxcl3Q6W5C0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cxcl3Q6W5C0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cxcl3Q6W5C0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxcl3Q6W5C0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxcl3Q6W5C0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cxcl3Q6W5C0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cxcl3Q6W5C0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cxcl3Q6W5C0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cxcl3Q6W5C0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cxcl3Q6W5C0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cxcl3Q6W5C0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cxcl3Q6W5C0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cxcl3Q6W5C0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cxcl3Q6W5C0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cxcl3Q6W5C0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cxcl3Q6W5C0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cxcl3Q6W5C0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cxcl3Q6W5C0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cxcl3Q6W5C0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cxcl3Q6W5C0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cxcl3Q6W5C0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cxcl3Q6W5C0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cxcl3Q6W5C0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cxcl3Q6W5C0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cxcl3Q6W5C0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cxcl3Q6W5C0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cxcl3Q6W5C0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cxcl3Q6W5C0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms