Protein–RNA interactions for Protein: Q6UJY2

Slc9c1, Sodium/hydrogen exchanger 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9c1Q6UJY2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Slc9c1Q6UJY2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Slc9c1Q6UJY2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Slc9c1Q6UJY2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Slc9c1Q6UJY2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Slc9c1Q6UJY2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Slc9c1Q6UJY2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Slc9c1Q6UJY2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Slc9c1Q6UJY2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Slc9c1Q6UJY2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Slc9c1Q6UJY2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Slc9c1Q6UJY2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Slc9c1Q6UJY2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Slc9c1Q6UJY2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Slc9c1Q6UJY2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Slc9c1Q6UJY2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Slc9c1Q6UJY2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Slc9c1Q6UJY2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Slc9c1Q6UJY2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Slc9c1Q6UJY2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Slc9c1Q6UJY2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Slc9c1Q6UJY2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Slc9c1Q6UJY2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Slc9c1Q6UJY2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Slc9c1Q6UJY2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Slc9c1Q6UJY2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Slc9c1Q6UJY2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Slc9c1Q6UJY2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Slc9c1Q6UJY2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Slc9c1Q6UJY2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Slc9c1Q6UJY2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Slc9c1Q6UJY2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Slc9c1Q6UJY2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Slc9c1Q6UJY2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Slc9c1Q6UJY2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Slc9c1Q6UJY2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Slc9c1Q6UJY2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Slc9c1Q6UJY2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Slc9c1Q6UJY2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Slc9c1Q6UJY2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Slc9c1Q6UJY2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Slc9c1Q6UJY2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Slc9c1Q6UJY2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Slc9c1Q6UJY2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Slc9c1Q6UJY2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Slc9c1Q6UJY2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slc9c1Q6UJY2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slc9c1Q6UJY2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Slc9c1Q6UJY2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slc9c1Q6UJY2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slc9c1Q6UJY2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Slc9c1Q6UJY2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Slc9c1Q6UJY2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Slc9c1Q6UJY2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Slc9c1Q6UJY2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Slc9c1Q6UJY2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Slc9c1Q6UJY2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Slc9c1Q6UJY2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slc9c1Q6UJY2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Slc9c1Q6UJY2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Slc9c1Q6UJY2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Slc9c1Q6UJY2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Slc9c1Q6UJY2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Slc9c1Q6UJY2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slc9c1Q6UJY2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Slc9c1Q6UJY2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slc9c1Q6UJY2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slc9c1Q6UJY2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Slc9c1Q6UJY2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Slc9c1Q6UJY2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slc9c1Q6UJY2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slc9c1Q6UJY2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Slc9c1Q6UJY2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Slc9c1Q6UJY2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slc9c1Q6UJY2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slc9c1Q6UJY2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slc9c1Q6UJY2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slc9c1Q6UJY2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slc9c1Q6UJY2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slc9c1Q6UJY2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Slc9c1Q6UJY2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Slc9c1Q6UJY2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slc9c1Q6UJY2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slc9c1Q6UJY2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slc9c1Q6UJY2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Slc9c1Q6UJY2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Slc9c1Q6UJY2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Slc9c1Q6UJY2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slc9c1Q6UJY2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slc9c1Q6UJY2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slc9c1Q6UJY2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slc9c1Q6UJY2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slc9c1Q6UJY2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Slc9c1Q6UJY2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Slc9c1Q6UJY2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Slc9c1Q6UJY2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Slc9c1Q6UJY2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Slc9c1Q6UJY2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slc9c1Q6UJY2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slc9c1Q6UJY2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms