Protein–RNA interactions for Protein: Q6R5N8

Tlr13, Toll-like receptor 13, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr13Q6R5N8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tlr13Q6R5N8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tlr13Q6R5N8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tlr13Q6R5N8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tlr13Q6R5N8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tlr13Q6R5N8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tlr13Q6R5N8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tlr13Q6R5N8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tlr13Q6R5N8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tlr13Q6R5N8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tlr13Q6R5N8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Tlr13Q6R5N8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Tlr13Q6R5N8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tlr13Q6R5N8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tlr13Q6R5N8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tlr13Q6R5N8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tlr13Q6R5N8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tlr13Q6R5N8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tlr13Q6R5N8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tlr13Q6R5N8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tlr13Q6R5N8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tlr13Q6R5N8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tlr13Q6R5N8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tlr13Q6R5N8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tlr13Q6R5N8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tlr13Q6R5N8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tlr13Q6R5N8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tlr13Q6R5N8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tlr13Q6R5N8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tlr13Q6R5N8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tlr13Q6R5N8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tlr13Q6R5N8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tlr13Q6R5N8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tlr13Q6R5N8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tlr13Q6R5N8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tlr13Q6R5N8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tlr13Q6R5N8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tlr13Q6R5N8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tlr13Q6R5N8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tlr13Q6R5N8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tlr13Q6R5N8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tlr13Q6R5N8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tlr13Q6R5N8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tlr13Q6R5N8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tlr13Q6R5N8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tlr13Q6R5N8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tlr13Q6R5N8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tlr13Q6R5N8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tlr13Q6R5N8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tlr13Q6R5N8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tlr13Q6R5N8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tlr13Q6R5N8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tlr13Q6R5N8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tlr13Q6R5N8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tlr13Q6R5N8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tlr13Q6R5N8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tlr13Q6R5N8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tlr13Q6R5N8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tlr13Q6R5N8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tlr13Q6R5N8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tlr13Q6R5N8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tlr13Q6R5N8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tlr13Q6R5N8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tlr13Q6R5N8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tlr13Q6R5N8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tlr13Q6R5N8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Tlr13Q6R5N8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Tlr13Q6R5N8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tlr13Q6R5N8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Tlr13Q6R5N8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tlr13Q6R5N8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Tlr13Q6R5N8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tlr13Q6R5N8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tlr13Q6R5N8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tlr13Q6R5N8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tlr13Q6R5N8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tlr13Q6R5N8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tlr13Q6R5N8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Tlr13Q6R5N8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tlr13Q6R5N8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tlr13Q6R5N8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tlr13Q6R5N8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tlr13Q6R5N8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tlr13Q6R5N8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tlr13Q6R5N8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tlr13Q6R5N8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tlr13Q6R5N8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tlr13Q6R5N8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tlr13Q6R5N8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tlr13Q6R5N8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tlr13Q6R5N8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tlr13Q6R5N8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tlr13Q6R5N8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tlr13Q6R5N8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Tlr13Q6R5N8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Tlr13Q6R5N8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tlr13Q6R5N8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tlr13Q6R5N8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tlr13Q6R5N8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tlr13Q6R5N8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms