Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nudcd1Q6PIP5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nudcd1Q6PIP5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nudcd1Q6PIP5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nudcd1Q6PIP5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nudcd1Q6PIP5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nudcd1Q6PIP5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nudcd1Q6PIP5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nudcd1Q6PIP5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nudcd1Q6PIP5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nudcd1Q6PIP5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nudcd1Q6PIP5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nudcd1Q6PIP5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nudcd1Q6PIP5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nudcd1Q6PIP5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nudcd1Q6PIP5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nudcd1Q6PIP5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nudcd1Q6PIP5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nudcd1Q6PIP5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nudcd1Q6PIP5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nudcd1Q6PIP5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nudcd1Q6PIP5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Nudcd1Q6PIP5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nudcd1Q6PIP5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nudcd1Q6PIP5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nudcd1Q6PIP5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nudcd1Q6PIP5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nudcd1Q6PIP5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nudcd1Q6PIP5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nudcd1Q6PIP5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nudcd1Q6PIP5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nudcd1Q6PIP5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nudcd1Q6PIP5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nudcd1Q6PIP5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nudcd1Q6PIP5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nudcd1Q6PIP5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nudcd1Q6PIP5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nudcd1Q6PIP5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nudcd1Q6PIP5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nudcd1Q6PIP5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nudcd1Q6PIP5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nudcd1Q6PIP5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nudcd1Q6PIP5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nudcd1Q6PIP5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Nudcd1Q6PIP5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nudcd1Q6PIP5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nudcd1Q6PIP5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nudcd1Q6PIP5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nudcd1Q6PIP5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Nudcd1Q6PIP5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nudcd1Q6PIP5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Nudcd1Q6PIP5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nudcd1Q6PIP5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nudcd1Q6PIP5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nudcd1Q6PIP5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nudcd1Q6PIP5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nudcd1Q6PIP5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nudcd1Q6PIP5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nudcd1Q6PIP5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nudcd1Q6PIP5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nudcd1Q6PIP5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nudcd1Q6PIP5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nudcd1Q6PIP5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nudcd1Q6PIP5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nudcd1Q6PIP5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nudcd1Q6PIP5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nudcd1Q6PIP5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nudcd1Q6PIP5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nudcd1Q6PIP5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nudcd1Q6PIP5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nudcd1Q6PIP5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nudcd1Q6PIP5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nudcd1Q6PIP5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nudcd1Q6PIP5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nudcd1Q6PIP5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nudcd1Q6PIP5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nudcd1Q6PIP5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nudcd1Q6PIP5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nudcd1Q6PIP5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nudcd1Q6PIP5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nudcd1Q6PIP5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nudcd1Q6PIP5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nudcd1Q6PIP5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nudcd1Q6PIP5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nudcd1Q6PIP5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nudcd1Q6PIP5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nudcd1Q6PIP5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nudcd1Q6PIP5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nudcd1Q6PIP5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nudcd1Q6PIP5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nudcd1Q6PIP5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nudcd1Q6PIP5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nudcd1Q6PIP5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nudcd1Q6PIP5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nudcd1Q6PIP5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nudcd1Q6PIP5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nudcd1Q6PIP5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nudcd1Q6PIP5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nudcd1Q6PIP5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nudcd1Q6PIP5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 306.9 ms