Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NfrkbQ6PIJ4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NfrkbQ6PIJ4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NfrkbQ6PIJ4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NfrkbQ6PIJ4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NfrkbQ6PIJ4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NfrkbQ6PIJ4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NfrkbQ6PIJ4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NfrkbQ6PIJ4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NfrkbQ6PIJ4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NfrkbQ6PIJ4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NfrkbQ6PIJ4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NfrkbQ6PIJ4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NfrkbQ6PIJ4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NfrkbQ6PIJ4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NfrkbQ6PIJ4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NfrkbQ6PIJ4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NfrkbQ6PIJ4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NfrkbQ6PIJ4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
NfrkbQ6PIJ4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NfrkbQ6PIJ4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NfrkbQ6PIJ4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NfrkbQ6PIJ4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NfrkbQ6PIJ4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NfrkbQ6PIJ4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NfrkbQ6PIJ4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NfrkbQ6PIJ4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NfrkbQ6PIJ4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NfrkbQ6PIJ4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NfrkbQ6PIJ4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NfrkbQ6PIJ4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NfrkbQ6PIJ4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NfrkbQ6PIJ4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NfrkbQ6PIJ4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NfrkbQ6PIJ4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NfrkbQ6PIJ4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NfrkbQ6PIJ4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NfrkbQ6PIJ4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NfrkbQ6PIJ4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NfrkbQ6PIJ4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NfrkbQ6PIJ4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NfrkbQ6PIJ4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NfrkbQ6PIJ4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NfrkbQ6PIJ4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NfrkbQ6PIJ4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NfrkbQ6PIJ4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NfrkbQ6PIJ4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NfrkbQ6PIJ4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NfrkbQ6PIJ4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NfrkbQ6PIJ4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NfrkbQ6PIJ4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NfrkbQ6PIJ4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NfrkbQ6PIJ4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NfrkbQ6PIJ4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NfrkbQ6PIJ4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NfrkbQ6PIJ4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NfrkbQ6PIJ4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NfrkbQ6PIJ4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NfrkbQ6PIJ4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NfrkbQ6PIJ4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NfrkbQ6PIJ4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NfrkbQ6PIJ4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NfrkbQ6PIJ4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NfrkbQ6PIJ4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NfrkbQ6PIJ4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NfrkbQ6PIJ4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NfrkbQ6PIJ4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
NfrkbQ6PIJ4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NfrkbQ6PIJ4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NfrkbQ6PIJ4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NfrkbQ6PIJ4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NfrkbQ6PIJ4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NfrkbQ6PIJ4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NfrkbQ6PIJ4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NfrkbQ6PIJ4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NfrkbQ6PIJ4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NfrkbQ6PIJ4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NfrkbQ6PIJ4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NfrkbQ6PIJ4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NfrkbQ6PIJ4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NfrkbQ6PIJ4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NfrkbQ6PIJ4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NfrkbQ6PIJ4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NfrkbQ6PIJ4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NfrkbQ6PIJ4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NfrkbQ6PIJ4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NfrkbQ6PIJ4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NfrkbQ6PIJ4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NfrkbQ6PIJ4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NfrkbQ6PIJ4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NfrkbQ6PIJ4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NfrkbQ6PIJ4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NfrkbQ6PIJ4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NfrkbQ6PIJ4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NfrkbQ6PIJ4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NfrkbQ6PIJ4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NfrkbQ6PIJ4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NfrkbQ6PIJ4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NfrkbQ6PIJ4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NfrkbQ6PIJ4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.6 ms