Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ecm29Q6PDI5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ecm29Q6PDI5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ecm29Q6PDI5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ecm29Q6PDI5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ecm29Q6PDI5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ecm29Q6PDI5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ecm29Q6PDI5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ecm29Q6PDI5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Ecm29Q6PDI5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ecm29Q6PDI5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ecm29Q6PDI5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ecm29Q6PDI5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ecm29Q6PDI5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ecm29Q6PDI5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ecm29Q6PDI5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ecm29Q6PDI5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ecm29Q6PDI5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ecm29Q6PDI5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ecm29Q6PDI5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ecm29Q6PDI5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ecm29Q6PDI5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ecm29Q6PDI5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ecm29Q6PDI5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ecm29Q6PDI5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ecm29Q6PDI5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ecm29Q6PDI5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ecm29Q6PDI5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ecm29Q6PDI5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ecm29Q6PDI5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ecm29Q6PDI5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ecm29Q6PDI5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ecm29Q6PDI5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ecm29Q6PDI5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ecm29Q6PDI5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ecm29Q6PDI5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ecm29Q6PDI5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ecm29Q6PDI5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ecm29Q6PDI5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ecm29Q6PDI5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ecm29Q6PDI5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ecm29Q6PDI5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ecm29Q6PDI5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ecm29Q6PDI5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ecm29Q6PDI5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ecm29Q6PDI5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ecm29Q6PDI5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ecm29Q6PDI5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ecm29Q6PDI5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ecm29Q6PDI5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ecm29Q6PDI5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ecm29Q6PDI5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Ecm29Q6PDI5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ecm29Q6PDI5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ecm29Q6PDI5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ecm29Q6PDI5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ecm29Q6PDI5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ecm29Q6PDI5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Ecm29Q6PDI5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ecm29Q6PDI5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ecm29Q6PDI5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ecm29Q6PDI5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ecm29Q6PDI5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ecm29Q6PDI5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ecm29Q6PDI5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Ecm29Q6PDI5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ecm29Q6PDI5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ecm29Q6PDI5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ecm29Q6PDI5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Ecm29Q6PDI5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ecm29Q6PDI5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ecm29Q6PDI5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ecm29Q6PDI5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ecm29Q6PDI5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ecm29Q6PDI5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ecm29Q6PDI5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ecm29Q6PDI5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ecm29Q6PDI5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ecm29Q6PDI5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ecm29Q6PDI5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ecm29Q6PDI5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ecm29Q6PDI5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ecm29Q6PDI5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ecm29Q6PDI5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ecm29Q6PDI5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ecm29Q6PDI5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ecm29Q6PDI5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ecm29Q6PDI5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ecm29Q6PDI5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ecm29Q6PDI5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ecm29Q6PDI5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ecm29Q6PDI5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ecm29Q6PDI5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Ecm29Q6PDI5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ecm29Q6PDI5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ecm29Q6PDI5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ecm29Q6PDI5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ecm29Q6PDI5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ecm29Q6PDI5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ecm29Q6PDI5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms