Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAQ4

Rexo4, RNA exonuclease 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo4Q6PAQ4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rexo4Q6PAQ4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rexo4Q6PAQ4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rexo4Q6PAQ4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rexo4Q6PAQ4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rexo4Q6PAQ4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rexo4Q6PAQ4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Rexo4Q6PAQ4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rexo4Q6PAQ4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rexo4Q6PAQ4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rexo4Q6PAQ4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rexo4Q6PAQ4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rexo4Q6PAQ4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rexo4Q6PAQ4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rexo4Q6PAQ4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rexo4Q6PAQ4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rexo4Q6PAQ4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rexo4Q6PAQ4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rexo4Q6PAQ4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rexo4Q6PAQ4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rexo4Q6PAQ4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rexo4Q6PAQ4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rexo4Q6PAQ4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rexo4Q6PAQ4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rexo4Q6PAQ4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rexo4Q6PAQ4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rexo4Q6PAQ4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rexo4Q6PAQ4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rexo4Q6PAQ4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rexo4Q6PAQ4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rexo4Q6PAQ4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rexo4Q6PAQ4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rexo4Q6PAQ4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rexo4Q6PAQ4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rexo4Q6PAQ4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rexo4Q6PAQ4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rexo4Q6PAQ4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rexo4Q6PAQ4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rexo4Q6PAQ4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rexo4Q6PAQ4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rexo4Q6PAQ4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rexo4Q6PAQ4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rexo4Q6PAQ4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rexo4Q6PAQ4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rexo4Q6PAQ4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rexo4Q6PAQ4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rexo4Q6PAQ4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rexo4Q6PAQ4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rexo4Q6PAQ4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rexo4Q6PAQ4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rexo4Q6PAQ4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rexo4Q6PAQ4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rexo4Q6PAQ4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rexo4Q6PAQ4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rexo4Q6PAQ4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rexo4Q6PAQ4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rexo4Q6PAQ4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rexo4Q6PAQ4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rexo4Q6PAQ4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rexo4Q6PAQ4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rexo4Q6PAQ4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rexo4Q6PAQ4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Rexo4Q6PAQ4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rexo4Q6PAQ4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rexo4Q6PAQ4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Rexo4Q6PAQ4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rexo4Q6PAQ4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rexo4Q6PAQ4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rexo4Q6PAQ4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rexo4Q6PAQ4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rexo4Q6PAQ4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rexo4Q6PAQ4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rexo4Q6PAQ4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rexo4Q6PAQ4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rexo4Q6PAQ4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rexo4Q6PAQ4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rexo4Q6PAQ4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rexo4Q6PAQ4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rexo4Q6PAQ4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rexo4Q6PAQ4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rexo4Q6PAQ4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rexo4Q6PAQ4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rexo4Q6PAQ4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rexo4Q6PAQ4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rexo4Q6PAQ4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rexo4Q6PAQ4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rexo4Q6PAQ4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rexo4Q6PAQ4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rexo4Q6PAQ4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rexo4Q6PAQ4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rexo4Q6PAQ4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rexo4Q6PAQ4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rexo4Q6PAQ4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rexo4Q6PAQ4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rexo4Q6PAQ4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rexo4Q6PAQ4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rexo4Q6PAQ4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rexo4Q6PAQ4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rexo4Q6PAQ4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rexo4Q6PAQ4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms