Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8X1

Snx6, Sorting nexin-6, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx6Q6P8X1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx6Q6P8X1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx6Q6P8X1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx6Q6P8X1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx6Q6P8X1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx6Q6P8X1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx6Q6P8X1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx6Q6P8X1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx6Q6P8X1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snx6Q6P8X1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx6Q6P8X1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx6Q6P8X1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx6Q6P8X1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx6Q6P8X1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx6Q6P8X1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx6Q6P8X1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx6Q6P8X1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx6Q6P8X1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx6Q6P8X1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx6Q6P8X1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx6Q6P8X1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx6Q6P8X1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx6Q6P8X1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx6Q6P8X1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx6Q6P8X1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx6Q6P8X1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx6Q6P8X1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx6Q6P8X1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx6Q6P8X1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx6Q6P8X1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx6Q6P8X1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Snx6Q6P8X1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Snx6Q6P8X1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx6Q6P8X1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx6Q6P8X1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx6Q6P8X1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx6Q6P8X1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx6Q6P8X1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx6Q6P8X1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx6Q6P8X1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx6Q6P8X1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx6Q6P8X1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx6Q6P8X1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx6Q6P8X1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx6Q6P8X1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx6Q6P8X1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx6Q6P8X1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx6Q6P8X1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx6Q6P8X1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx6Q6P8X1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx6Q6P8X1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx6Q6P8X1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx6Q6P8X1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx6Q6P8X1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx6Q6P8X1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx6Q6P8X1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx6Q6P8X1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx6Q6P8X1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx6Q6P8X1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx6Q6P8X1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx6Q6P8X1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx6Q6P8X1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx6Q6P8X1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx6Q6P8X1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx6Q6P8X1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx6Q6P8X1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx6Q6P8X1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx6Q6P8X1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx6Q6P8X1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx6Q6P8X1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx6Q6P8X1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx6Q6P8X1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx6Q6P8X1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx6Q6P8X1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx6Q6P8X1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx6Q6P8X1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx6Q6P8X1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx6Q6P8X1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx6Q6P8X1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx6Q6P8X1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx6Q6P8X1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx6Q6P8X1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx6Q6P8X1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx6Q6P8X1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx6Q6P8X1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx6Q6P8X1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx6Q6P8X1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx6Q6P8X1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx6Q6P8X1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx6Q6P8X1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx6Q6P8X1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx6Q6P8X1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx6Q6P8X1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx6Q6P8X1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx6Q6P8X1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx6Q6P8X1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx6Q6P8X1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx6Q6P8X1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx6Q6P8X1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx6Q6P8X1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms