Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp2d40Q6P8N9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp2d40Q6P8N9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp2d40Q6P8N9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp2d40Q6P8N9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp2d40Q6P8N9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp2d40Q6P8N9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp2d40Q6P8N9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp2d40Q6P8N9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp2d40Q6P8N9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp2d40Q6P8N9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp2d40Q6P8N9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp2d40Q6P8N9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp2d40Q6P8N9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp2d40Q6P8N9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp2d40Q6P8N9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp2d40Q6P8N9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp2d40Q6P8N9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp2d40Q6P8N9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp2d40Q6P8N9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp2d40Q6P8N9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp2d40Q6P8N9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp2d40Q6P8N9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp2d40Q6P8N9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp2d40Q6P8N9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp2d40Q6P8N9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp2d40Q6P8N9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp2d40Q6P8N9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp2d40Q6P8N9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp2d40Q6P8N9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp2d40Q6P8N9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp2d40Q6P8N9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp2d40Q6P8N9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp2d40Q6P8N9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp2d40Q6P8N9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp2d40Q6P8N9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp2d40Q6P8N9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp2d40Q6P8N9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp2d40Q6P8N9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp2d40Q6P8N9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp2d40Q6P8N9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp2d40Q6P8N9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp2d40Q6P8N9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp2d40Q6P8N9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp2d40Q6P8N9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp2d40Q6P8N9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp2d40Q6P8N9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp2d40Q6P8N9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp2d40Q6P8N9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp2d40Q6P8N9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp2d40Q6P8N9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp2d40Q6P8N9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp2d40Q6P8N9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp2d40Q6P8N9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp2d40Q6P8N9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp2d40Q6P8N9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp2d40Q6P8N9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp2d40Q6P8N9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp2d40Q6P8N9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyp2d40Q6P8N9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyp2d40Q6P8N9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyp2d40Q6P8N9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cyp2d40Q6P8N9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cyp2d40Q6P8N9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cyp2d40Q6P8N9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cyp2d40Q6P8N9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cyp2d40Q6P8N9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cyp2d40Q6P8N9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cyp2d40Q6P8N9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cyp2d40Q6P8N9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cyp2d40Q6P8N9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cyp2d40Q6P8N9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cyp2d40Q6P8N9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cyp2d40Q6P8N9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cyp2d40Q6P8N9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cyp2d40Q6P8N9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cyp2d40Q6P8N9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cyp2d40Q6P8N9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cyp2d40Q6P8N9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cyp2d40Q6P8N9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cyp2d40Q6P8N9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cyp2d40Q6P8N9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cyp2d40Q6P8N9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cyp2d40Q6P8N9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cyp2d40Q6P8N9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cyp2d40Q6P8N9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cyp2d40Q6P8N9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cyp2d40Q6P8N9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cyp2d40Q6P8N9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cyp2d40Q6P8N9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cyp2d40Q6P8N9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cyp2d40Q6P8N9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyp2d40Q6P8N9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyp2d40Q6P8N9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyp2d40Q6P8N9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cyp2d40Q6P8N9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cyp2d40Q6P8N9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms