Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6P7

Parp6, Poly [ADP-ribose] polymerase 6, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp6Q6P6P7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Parp6Q6P6P7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Parp6Q6P6P7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Parp6Q6P6P7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Parp6Q6P6P7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Parp6Q6P6P7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Parp6Q6P6P7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Parp6Q6P6P7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Parp6Q6P6P7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Parp6Q6P6P7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Parp6Q6P6P7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Parp6Q6P6P7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Parp6Q6P6P7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Parp6Q6P6P7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Parp6Q6P6P7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Parp6Q6P6P7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Parp6Q6P6P7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Parp6Q6P6P7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Parp6Q6P6P7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Parp6Q6P6P7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Parp6Q6P6P7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Parp6Q6P6P7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Parp6Q6P6P7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Parp6Q6P6P7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Parp6Q6P6P7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Parp6Q6P6P7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Parp6Q6P6P7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Parp6Q6P6P7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Parp6Q6P6P7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Parp6Q6P6P7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Parp6Q6P6P7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Parp6Q6P6P7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Parp6Q6P6P7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Parp6Q6P6P7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Parp6Q6P6P7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Parp6Q6P6P7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Parp6Q6P6P7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Parp6Q6P6P7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Parp6Q6P6P7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Parp6Q6P6P7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Parp6Q6P6P7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Parp6Q6P6P7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Parp6Q6P6P7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Parp6Q6P6P7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Parp6Q6P6P7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Parp6Q6P6P7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Parp6Q6P6P7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Parp6Q6P6P7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Parp6Q6P6P7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Parp6Q6P6P7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Parp6Q6P6P7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Parp6Q6P6P7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Parp6Q6P6P7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Parp6Q6P6P7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Parp6Q6P6P7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Parp6Q6P6P7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Parp6Q6P6P7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Parp6Q6P6P7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Parp6Q6P6P7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Parp6Q6P6P7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Parp6Q6P6P7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Parp6Q6P6P7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Parp6Q6P6P7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Parp6Q6P6P7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Parp6Q6P6P7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Parp6Q6P6P7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Parp6Q6P6P7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Parp6Q6P6P7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Parp6Q6P6P7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Parp6Q6P6P7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Parp6Q6P6P7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Parp6Q6P6P7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Parp6Q6P6P7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Parp6Q6P6P7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Parp6Q6P6P7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Parp6Q6P6P7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Parp6Q6P6P7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Parp6Q6P6P7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Parp6Q6P6P7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Parp6Q6P6P7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Parp6Q6P6P7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Parp6Q6P6P7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Parp6Q6P6P7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Parp6Q6P6P7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Parp6Q6P6P7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Parp6Q6P6P7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Parp6Q6P6P7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Parp6Q6P6P7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Parp6Q6P6P7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Parp6Q6P6P7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Parp6Q6P6P7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Parp6Q6P6P7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Parp6Q6P6P7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Parp6Q6P6P7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Parp6Q6P6P7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Parp6Q6P6P7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Parp6Q6P6P7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Parp6Q6P6P7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Parp6Q6P6P7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Parp6Q6P6P7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms