Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1G2

Kdm2b, Lysine-specific demethylase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2bQ6P1G2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Kdm2bQ6P1G2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Kdm2bQ6P1G2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Kdm2bQ6P1G2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Kdm2bQ6P1G2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Kdm2bQ6P1G2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Kdm2bQ6P1G2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Kdm2bQ6P1G2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Kdm2bQ6P1G2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Kdm2bQ6P1G2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Kdm2bQ6P1G2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Kdm2bQ6P1G2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Kdm2bQ6P1G2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Kdm2bQ6P1G2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Kdm2bQ6P1G2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Kdm2bQ6P1G2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Kdm2bQ6P1G2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Kdm2bQ6P1G2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Kdm2bQ6P1G2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Kdm2bQ6P1G2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Kdm2bQ6P1G2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Kdm2bQ6P1G2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Kdm2bQ6P1G2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Kdm2bQ6P1G2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Kdm2bQ6P1G2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Kdm2bQ6P1G2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Kdm2bQ6P1G2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Kdm2bQ6P1G2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Kdm2bQ6P1G2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Kdm2bQ6P1G2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Kdm2bQ6P1G2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Kdm2bQ6P1G2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Kdm2bQ6P1G2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Kdm2bQ6P1G2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Kdm2bQ6P1G2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Kdm2bQ6P1G2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Kdm2bQ6P1G2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Kdm2bQ6P1G2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Kdm2bQ6P1G2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Kdm2bQ6P1G2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Kdm2bQ6P1G2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Kdm2bQ6P1G2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Kdm2bQ6P1G2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Kdm2bQ6P1G2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Kdm2bQ6P1G2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Kdm2bQ6P1G2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Kdm2bQ6P1G2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Kdm2bQ6P1G2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Kdm2bQ6P1G2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Kdm2bQ6P1G2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Kdm2bQ6P1G2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Kdm2bQ6P1G2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Kdm2bQ6P1G2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Kdm2bQ6P1G2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Kdm2bQ6P1G2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Kdm2bQ6P1G2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Kdm2bQ6P1G2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Kdm2bQ6P1G2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Kdm2bQ6P1G2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Kdm2bQ6P1G2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Kdm2bQ6P1G2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Kdm2bQ6P1G2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Kdm2bQ6P1G2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Kdm2bQ6P1G2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Kdm2bQ6P1G2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Kdm2bQ6P1G2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Kdm2bQ6P1G2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Kdm2bQ6P1G2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Kdm2bQ6P1G2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Kdm2bQ6P1G2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Kdm2bQ6P1G2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Kdm2bQ6P1G2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Kdm2bQ6P1G2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Kdm2bQ6P1G2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Kdm2bQ6P1G2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Kdm2bQ6P1G2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Kdm2bQ6P1G2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Kdm2bQ6P1G2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Kdm2bQ6P1G2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Kdm2bQ6P1G2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Kdm2bQ6P1G2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Kdm2bQ6P1G2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Kdm2bQ6P1G2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Kdm2bQ6P1G2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Kdm2bQ6P1G2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Kdm2bQ6P1G2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Kdm2bQ6P1G2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Kdm2bQ6P1G2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Kdm2bQ6P1G2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Kdm2bQ6P1G2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Kdm2bQ6P1G2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Kdm2bQ6P1G2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Kdm2bQ6P1G2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Kdm2bQ6P1G2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Kdm2bQ6P1G2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Kdm2bQ6P1G2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Kdm2bQ6P1G2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Kdm2bQ6P1G2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Kdm2bQ6P1G2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Kdm2bQ6P1G2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms