Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQT9

Nomo1, Nodal modulator 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nomo1Q6GQT9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nomo1Q6GQT9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nomo1Q6GQT9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nomo1Q6GQT9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nomo1Q6GQT9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nomo1Q6GQT9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nomo1Q6GQT9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nomo1Q6GQT9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nomo1Q6GQT9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nomo1Q6GQT9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nomo1Q6GQT9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nomo1Q6GQT9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nomo1Q6GQT9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nomo1Q6GQT9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nomo1Q6GQT9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nomo1Q6GQT9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Nomo1Q6GQT9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nomo1Q6GQT9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nomo1Q6GQT9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Nomo1Q6GQT9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nomo1Q6GQT9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nomo1Q6GQT9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nomo1Q6GQT9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nomo1Q6GQT9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nomo1Q6GQT9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nomo1Q6GQT9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nomo1Q6GQT9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Nomo1Q6GQT9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Nomo1Q6GQT9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nomo1Q6GQT9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nomo1Q6GQT9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nomo1Q6GQT9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nomo1Q6GQT9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nomo1Q6GQT9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nomo1Q6GQT9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nomo1Q6GQT9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nomo1Q6GQT9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nomo1Q6GQT9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nomo1Q6GQT9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nomo1Q6GQT9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nomo1Q6GQT9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nomo1Q6GQT9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nomo1Q6GQT9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nomo1Q6GQT9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nomo1Q6GQT9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nomo1Q6GQT9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nomo1Q6GQT9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nomo1Q6GQT9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nomo1Q6GQT9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nomo1Q6GQT9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nomo1Q6GQT9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nomo1Q6GQT9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nomo1Q6GQT9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nomo1Q6GQT9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nomo1Q6GQT9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nomo1Q6GQT9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nomo1Q6GQT9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nomo1Q6GQT9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nomo1Q6GQT9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nomo1Q6GQT9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nomo1Q6GQT9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nomo1Q6GQT9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nomo1Q6GQT9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nomo1Q6GQT9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nomo1Q6GQT9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nomo1Q6GQT9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nomo1Q6GQT9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nomo1Q6GQT9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nomo1Q6GQT9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nomo1Q6GQT9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nomo1Q6GQT9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nomo1Q6GQT9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nomo1Q6GQT9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nomo1Q6GQT9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nomo1Q6GQT9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Nomo1Q6GQT9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nomo1Q6GQT9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Nomo1Q6GQT9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nomo1Q6GQT9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nomo1Q6GQT9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nomo1Q6GQT9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nomo1Q6GQT9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nomo1Q6GQT9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Nomo1Q6GQT9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nomo1Q6GQT9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nomo1Q6GQT9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nomo1Q6GQT9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nomo1Q6GQT9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nomo1Q6GQT9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nomo1Q6GQT9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nomo1Q6GQT9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nomo1Q6GQT9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nomo1Q6GQT9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nomo1Q6GQT9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nomo1Q6GQT9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nomo1Q6GQT9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nomo1Q6GQT9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nomo1Q6GQT9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nomo1Q6GQT9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Nomo1Q6GQT9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms